绣球花序大小全基因组关联分析

作     者：李金帅 邱帅 张宪权 高凯 杨君 秦俊 刘群录 LI Jinshuai;QIU Shuai;ZHANG Xianquan;GAO Kai;YANG Jun;QIN Jun;LIU Qunlu

作者机构：上海交通大学设计学院上海200240 杭州市园林绿化股份有限公司杭州310020 上海辰山植物园上海201602 上海城市树木生态应用工程技术研究中心上海200020 

基　　金：上海市绿化和市容管理局2021年科学技术攻关项目(G212410) 

出 版 物：《植物生理学报》 (Plant Physiology Journal)

年 卷 期：2022年第58卷第8期

页      码：1519-1527页

摘      要：花序大小是评价绣球花观赏性的重要指标,通常用花序直径来衡量植物花序的大小。全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)能够识别与特定性状相关联的分子标记;利用这些分子标记可以进行分子标记辅助育种(molecular marker-assisted breeding,MAB),从而加快新品种的选育。本研究以125份绣球植株为材料,基于基因组重测序获得的SNP分子标记,利用混合线性模型(mixed linear model,MLM)进行全基因组关联分析,定位控制花序大小的关键基因。结果表明,通过GWAS分析检测到24个与花序大小相关的SNP位点[-log_(10)P≥5],表型贡献率在5.01%~23.48%之间;对定位的24个SNP位点进行基因注释,获得了74个候选基因,其中68个基因位于基因间隔区,6个位于基因编码区。在74个候选基因中57个具有基因功能注释,另外17个未能注释。根据注释结果,获得了6个与花序大小发育相关的基因,包括3个植物生长素响应基因(SAUR)、1个扩张蛋白基因、1个吲哚-3-乙酸诱导蛋白基因(ARG7)以及1个ABC转运蛋白基因。

主 题 词：绣球 花序大小 全基因组关联分析 

学科分类：090706[090706] 0907[农学-草药学] 09[农学] 

核心收录：

D　O　I：10.13592/j.cnki.ppj.100053

馆 藏 号：203114362...