真菌基因组组装技术在《农业微生物学》开放实验中的设计与实践

作     者：李诚 杨再福 王勇 LI Cheng;YANG Zaifu;WANG Yong

作者机构：贵州大学农学院植物病理学教研室贵州贵阳550025 

基　　金：贵州省科技计划基础研究项目(黔科合基础-ZK一般142) 贵州大学引进人才科研项目(贵大人基合字35号) 贵州大学培育项目(贵大培育24号和贵大培育13号) 

出 版 物：《创新创业理论研究与实践》 (The Theory and Practice of Innovation and Enterpreneurship)

年 卷 期：2022年第5卷第15期

页      码：182-184页

摘      要：通过基因组组装技术获得高质量的基因组信息是开展真菌基因组学研究的前提。近年来,该技术在微生物研究领域应用广泛。为在本科教学中推广该技术,贵州大学农学院在院级平台课《农业微生物学》中设计开放实验,让植物保护本科专业的学生分组实践。具体实验内容为以HGAP4、Canu和MECAT对天麻褐腐病菌Fusarium oxysporum测序数据的基因组进行组装,并通过Quick Merge软件整合后得到最终的基因组序列,通过实践提高学生对微生物基因组研究的兴趣及动手能力,进而丰富教学内容,提高教学质量。

主 题 词：基因组组装 《农业微生物学》 开放实验 组装软件 实验分析 实践 

学科分类：0401[教育学-教育学类] 04[教育学] 040102[040102] 

馆 藏 号：203114388...