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玉米ZmPRR1-1基因启动子的克隆及序列分析

玉米ZmPRR1-1基因启动子的克隆及序列分析

作     者:仝帧翰 刘青青 张严玲 王雷立 李安然 董柯清 王闻琦 王盼盼 王翠玲 TONG Zhenhan;LIU Qingqing;ZHANG Yanling;WANG Leili;LI Anran;DONG Keqing;WANG Wenqi;WANG Panpan;WANG Cuiling

作者机构:河南科技大学河南洛阳471023 

基  金:国家自然科学基金河南省联合基金(U2004153) 河南省重点研发与推广专项(科技攻关)(202102110010) 国家自然科学基金青年基金(31901561) 

出 版 物:《作物研究》 (Crop Research)

年 卷 期:2022年第36卷第4期

页      码:354-362页

摘      要:克隆玉米伪应答调控基因ZmPRR1-1启动子并对其序列进行分析,以期为深入研究ZmPRR1-1基因的调控机制及基因功能提供参考。以玉米黄早4的叶片为供试材料,参考已公布玉米自交系CML247基因组中Zm-PRR1-1启动子的序列信息设计引物,克隆ZmPRR1-1基因的启动子,并利用生物信息学对启动子中的核心区域、顺式作用元件、转录因子结合位点和CpG岛进行预测分析。克隆得到长度约2600 bp的ZmPRR1-1启动子,预测ZmPRR1-1启动子可能存在2个核心启动子区域,除了存在核心元件TATA-box和启动子增强元件CAAT-box外,还存在光响应、激素应答、胁迫响应等顺式作用元件。转录因子结合位点分析表明,ZmPRR1-1启动子区中预测包含ERF在内的6种转录因子家族,此外在启动子区域中预测存在4个符合限定条件的CpG岛区域。玉米ZmPRR1-1启动子区域存在丰富的顺式作用元件和转录因子结合位点,暗示ZmPRR1-1可能受到外界多种类型调控因子的调控并启动转录起始,且在多种调控网络中发挥功能。

主 题 词:玉米 PRR基因 启动子 克隆 生物信息学分析 

学科分类:09[农学] 0901[农学-植物生产类] 

D O I:10.16848/j.cnki.issn.1001-5280.2022.04.12

馆 藏 号:203114445...

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