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基于符号化进化动力学的基因组数据采掘

基于符号化进化动力学的基因组数据采掘

作     者:刘健勤 

作者机构:中南工业大学信息工程学院 

基  金:前国家教委留学回国人员科研启动基金 前国家教委国家信息处理与智能控制开放实验室基金 湖南省自然科学基金 前中国有色金属工业总公司"十百千人才"基金 

出 版 物:《中国有色金属学报》 (The Chinese Journal of Nonferrous Metals)

年 卷 期:1999年第9卷第2期

页      码:345-350页

摘      要:提出了一种新的基因组数据模型和模式发现算法。该模型由人工基因组、人工蛋白、进化操作、进化控制、模式匹配、终止判断6个环节组成,其中抽象代数结构由格集合构形和相应有限状态机操作来动态描述,候选符号序列由符号动力学引导的进化算法所生成,进化程度由粗糙集所刻划的元进化机制所控制,模式匹配由句法模式识别器和文法推断过程所完成,终止判断依具体问题求解的约束条件而定。相应的算法为循环性的群体隐式并行搜索,数据结构以答号化粗粒度的处理为主,并与面向语义的模块化程序设计相配合。在该人工生命技术的应用中,由计算机自动生成了候选符号序列,从中获得了“真实”的氨基酸序列。实验结果表明,所提出并实现的计算方法有助于基因组学层次下的生物信息学的统一计算理论的建立和应用系统开发。

主 题 词:基因组学 生物信息学 进化计算 人工生命 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 081203[081203] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0835[0835] 0836[0836] 090102[090102] 0812[工学-测绘类] 

核心收录:

D O I:10.3321/j.issn:1004-0609.1999.02.026

馆 藏 号:203114876...

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