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口腔鳞状细胞癌及癌旁正常组织基因表达谱芯片检测

口腔鳞状细胞癌及癌旁正常组织基因表达谱芯片检测

作     者:郑建伟 杨淑娟 利小平 韦从云 李婷 莫文娟 蔡秋云 杨德群 周磊 罗刚 Zheng Jian-wei;Yang Shu-juan;Li Xiao-ping;Wei Cong-yun;Li Ting;Mo Wen-juan;Cai Qiu-yun;Yang De-qun;Zhou Lei;Luo Gang

作者机构:南方医科大学附属广东省口腔医院,广东省广州市 510280 广东省深圳牙科医疗中心,广东省深圳市 518001 四川大学华西公共卫生学院健康与社会行为学系四川省成都市610041 广东省深圳牙科医疗中心广东省深圳市518001 南方医科大学附属广东省口腔医院广东省广州市510280 

基  金:Funding:Medical Science Research Foundation of Guangdong Province of China, No. A2011092 the National Natural Science Foundation of China, No.81271159\H1405广东省医学科学研究基金资助项目(A2011092) 国家自然科学基金资助项目(81271159/H1405) 

出 版 物:《中国组织工程研究》 (Journal of Clinical Rehabilitative Tissue Engineering Research)

年 卷 期:2015年第19卷第27期

页      码:4365-4370页

摘      要:背景:近年在整体水平上以高通量分子扫描手段为基础的基因组学、蛋白质组学以及计算机辅助设计等技术的整合及相互关联的“技术链”的应用已在乳腺癌、肺癌、胃癌、结肠癌、卵巢癌、黑色素瘤等的研究中取得了丰硕的成果,但关于口腔鳞状细胞癌的研究较少。目的:实验通过基因表达谱芯片检测口腔鳞状细胞癌组织与癌旁正常组织的基因表达谱。方法:收集广东省口腔医院2013年手术切除的口腔鳞癌及癌旁正常组织各2例,采用Roche NimbleGen全基因组表达谱芯片进行口腔鳞癌及癌旁正常组织的基因表达谱检测。结果与结论:按差异基因筛选标准,从32448条检测基因中筛选出口腔鳞癌肿瘤组织的差异基因共有7872条,占筛选基因总数的24%;其中上调表达的基因有3800条,下调表达的有4072条。结果证实,通过基因表达谱芯片检测并根据表达差异1倍以上的筛选标准得到了7872个表达差异的基因。由此可见肿瘤的发生发展不是单个或几个基因的作用结果,以往实验往往针对某个或某几个基因的研究有很大的局限性。同时也说明了肿瘤的产生是多基因成网络相互调节作用的结果,而且这个网络的作用关系是非常复杂的。

主 题 词:实验动物 组织工程 口腔鳞状细胞癌 基因芯片 基因表达谱芯片 Roche NimbleGen全基因组表达谱芯片 差异基因 生物信息学分析 DNA 质量评价 国家自然科学基金 

学科分类:0831[工学-公安技术类] 08[工学] 0836[0836] 

D O I:10.3969/j.issn.2095-4344.2015.27.019

馆 藏 号:203115109...

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