GC夹对三种食源性致病菌的rpoB-PCR-DGGE图谱的影响

作     者：廖超 张昭寰 姚鑫 谢晶 张炜佳 潘迎捷 赵勇 LIAO Chao;ZHANG Zhao-huan;YAO Xin;XIE Jing;ZHANG Wei-jia;PAN Ying-jie;ZHAO Yong

作者机构：上海海洋大学食品学院上海201306 农业部水产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室上海201306 上海水产品加工及贮藏工程技术研究中心上海201306 

基　　金：国家自然科学基金面上项目(31271870) 上海市科委科技创新行动计划项目(14DZ1205100,14320502100) 上海市科技兴农重点攻关项目(沪农科攻字2014第3-5号,2005第4-8号) 上海市水产品加工及贮藏工程技术研究中心(11DZ2280300) 

出 版 物：《生物技术通报》 (Biotechnology Bulletin)

年 卷 期：2016年第32卷第5期

页      码：212-219页

摘      要：旨在探讨不同的GC夹以及GC夹连接引物的不同位置对3种食源性致病菌的DGGE图谱结果的影响,合成6对RNA聚合酶β亚基编码基因rpo B引物(rpo B 1-6),含3种不同GC夹(GC-1,GC-2,GC-3),且每种GC夹分别连接于正反引物5 端。应用rpo B-PCR-DGGE对副溶血性弧菌(5株),单增李斯特菌(5株)和沙门氏菌(3株)进行分析,并与V3-PCR-DGGE和ERIC-PCR的图谱及聚类分析结果进行比较。结果显示,GC-3夹连接于反引物上的rpo B-PCR-DGGE分辨效果最好,分辨力指数达0.9,与ERIC-PCR相同,高于V3-PCR-DGGE。GC夹序列和连接引物位置均对rpo B-PCR-DGGE图谱结果产生影响。选择或设计无连续鸟嘌呤(G)排列的GC夹序列且将其连接于反引物5 端,均能有效提高rpo B-PCR-DGGE对食源性致病菌检测与分型的效果。

主 题 词：副溶血性弧菌 单增李斯特菌 沙门氏菌 GC夹 rpo B-PCR-DGGE 

学科分类：1007[医学-药学类] 100705[100705] 1001[医学-基础医学] 100103[100103] 10[医学] 

D　O　I：10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2016.05.028

馆 藏 号：203115141...