基于比较基因组学的高地芽孢杆菌6ww6分子标识筛选及其快速鉴定

作     者：李旭健 杜秉海 殷志秋 程齐 周丹丹 汪城墙 李慧 刘凯 丁延芹 LI Xujian;DU Binghai;YIN Zhiqiu;CHENG Qi;ZHOU Dandan;WANG Chengqiang;LI Hui;LIU Kai;DING Yanqin

作者机构：山东农业大学生命科学学院山东泰安271018 山东省盐碱地植物-微生物联合修复工程技术中心山东泰安271018 山东农业大学资源与环境学院山东泰安271018 

基　　金：山东省重点研发计划(2021CXGC010804) 国家自然科学基金(31770115) 

出 版 物：《微生物学报》 (Acta Microbiologica Sinica)

年 卷 期：2022年第62卷第10期

页      码：3741-3750页

摘      要：【目的】高地芽孢杆菌(Bacillus altitudinis)6ww6是一株根际耐盐促生菌,可以作为微生物肥料的优选菌种。为了加强菌种知识产权保护,建立菌株快速检测方法。【方法】本研究通过基因组比对分析、TBLASTn检索、NR库检索验证并剔除有其他同源的结果序列,最终得到菌株6ww6的孤儿基因,设计引物进行PCR鉴定。【结果】筛选出5个特异性基因J939_13195、J9319_05960、J9319_13355、J9319_05965和J9319_13350。引物5960F和5960R可以单一性扩增出菌株6ww6的目的基因J9319_05960,确定其为菌株6ww6的特异性分子标识。【结论】本研究确定了菌株6ww6的唯一性身份编码,建立了以比较基因组学和孤儿基因为基础的菌株水平上的鉴定方法。该方法具有快速、精确、能鉴定到菌株水平的优点,对于有价值微生物的知识产权保护提供了有力的抓手。

主 题 词：微生物肥料 比较基因组学 菌株分子标识 高地芽孢杆菌6wW6 知识产权 

学科分类：09[农学] 0903[农学-动物生产类] 

核心收录：

D　O　I：10.13343/j.cnki.wsxb.20220066

馆 藏 号：203115359...