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新疆地区GIII.2型牛诺如病毒流行病学调查及ORF1基因遗传进化分析

新疆地区GIII.2型牛诺如病毒流行病学调查及ORF1基因遗传进化分析

作     者:马志刚 何琴 施晨阳 刘馨博 郭雪萍 吴静 马英才 苏战强 钟旗 姚刚 马雪连 MA Zhi-gang;HE Qin;SHI Chen-yang;LIU Xin-bo;GUO Xue-ping;WU Jing;MA Ying-cai;SU Zhan-qiang;ZHONG Qi;YAO Gang;MA Xue-lian

作者机构:新疆农业大学动物医学学院新疆乌鲁木齐830052 新疆畜牧科学院兽医研究所新疆乌鲁木齐830052 

基  金:奶牛养殖提质增效关键技术集成示范项目(2020A01001-2) 新疆草食动物重要病原防控研究创新团队项目(2020D14005) “肉牛母-犊一体化保健技术”在肉牛养殖产业中的示范推广项目(2020NC001) 

出 版 物:《中国预防兽医学报》 (Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine)

年 卷 期:2022年第44卷第8期

页      码:888-891,902页

摘      要:为调查牛诺如病毒(BNoV)在新疆不同地区牛场中的感染情况,本实验针对BNoV的RdRp基因设计特异性引物,采用RT-PCR方法对新疆乌鲁木齐、塔城、伊犁、喀什4个地区的7个牛场共230份牛粪便样品进行检测,并获得塔城地区一株BNoV开放阅读框1(ORF1)基因,对其进行遗传进化、同源性及基因重组分析。流行病学调查结果显示,新疆地区BNoV阳性率为17.83%(41/230),其中塔城地区阳性率最高(60.00%,9/15)。对检测的BNoV ORF1基因进行遗传进化分析,结果显示,其属于GIII.2型BNoV,与中国四川地区OK032546.1病毒株相似性最高(94.6%),聚为一支;同源性分析结果显示,本研究中检测到的两株BNoV的ORF1基因序列之间的同源性为100%,均与OK032546.1病毒株相应基因序列同源性最高(96.6%)。ORF1编码的氨基酸序列分析显示两株BNoV ORF1与MZ573179.1病毒株同源性最高(98.35%),且与国内外其他GIII.2型病毒株同源性在76.1%以上。通过对ORF1基因重组分析,结果显示,本研究检测到的BNoV与国内外经典株ORF1基因无基因重组现象。本研究填补了新疆地区对BNoV基因序列研究的空白,为BNoV感染的防制提供了参考依据。

主 题 词:牛诺如病毒 感染情况 ORF1基因 遗传进化分析 

学科分类:090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

D O I:10.3969/j.issn.1008-0589.202109041

馆 藏 号:203115450...

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