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简化基因组测序在畜禽应用中的研究进展

简化基因组测序在畜禽应用中的研究进展

作     者:陈亚飞 蒋秋菲 蔡正云 辛国省 顾亚玲 张娟 CHEN Yafei;JIANG Qiufei;CAI Zhengyun;XIN Guosheng;GU Yaling;ZHANG Juan

作者机构:宁夏大学农学院银川750021 宁夏畜牧工作站银川750021 宁夏饲料工程技术研究中心银川750021 

基  金:宁夏肉牛种群高效利用及优异性状选育关键技术研究(2021ZDYF1008) 

出 版 物:《黑龙江畜牧兽医》 (Heilongjiang Animal Science And veterinary Medicine)

年 卷 期:2022年第21期

页      码:35-40,136,137页

摘      要:简化基因组测序(reduced-representation genome sequencing,RRGS)是指利用生物信息学方法设计标记开发方案,富集特异性长度片段,应用高通量测序技术获得海量标签序列来代表目标物种全基因组信息的测序方法。通过RRGS能够发现更多新的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,为研究控制畜禽生长发育、肉质调控、代谢调节基因及其遗传进化多样性提供重要基础分析数据。文章主要对RRGS中的限制性酶切位点相关DNA测序(restriction-site associated DNA,RAD-seq)、2b-RAD(ⅡB restriction-site associated DNA)、双酶切简化基因组测序(double digest RAD,ddRAD-seq)和基因分型测序(genotyping by sequencing,GBS)四种技术原理及在畜禽分子标记开发、遗传图谱构建和数量性状定位(QTL)方面的应用进行综述,旨在为简化基因组测序在畜禽育种研究中的应用提供基础资料。

主 题 词:简化基因组 RAD-seq 2b-RAD ddRAD GBS 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

D O I:10.13881/j.cnki.hljxmsy.2022.01.0235

馆 藏 号:203115477...

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