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猪δ冠状病毒实时荧光RT-PCR检测方法的建立与应用

猪δ冠状病毒实时荧光RT-PCR检测方法的建立与应用

作     者:苑建军 杨德全 鞠厚斌 庄建萍 葛菲菲 杨显超 李鑫 沈海潇 Yuan Jianjun;Yang Dequan;Ju Houbin;Zhuang Jianping;Ge Feifei;Yang Xianchao;Li Xin;Shen Haixiao

作者机构:上海市崇明区动物疫病预防控制中心上海202150 上海市动物疫病预防控制中心上海201103 上海市嘉定区动物疫病预防控制中心上海201800 

基  金:上海市自然科学基金项目(04713) 

出 版 物:《中国动物检疫》 (China Animal Health Inspection)

年 卷 期:2022年第39卷第11期

页      码:115-120页

摘      要:为灵敏、快速检测猪δ冠状病毒(porcine deltacoronavirus,PDCoV),根据PDCoVM基因保守区域设计引物和探针,建立了一种PDCoV实时荧光RT-PCR检测方法,并评价了该方法的特异性、灵敏性和重复性。结果显示,该方法的拷贝数对数值与Ct值在1.3×10^(3)-1.3×10^(7) copies/μL拷贝数浓度范围内呈现良好的线性关系,R^(2)=0.994;最低检出限为13 copies/μL,且无非特异性扩增;批内和批间重复性试验变异系数(CV)为0.24%~2.15%,均小于3%。利用该方法和普通RT-PCR对42份临床样品同时进行检测,发现本方法比普通RT-PCR灵敏性更高,二者符合率为95.2%。以上结果表明,本试验建立的实时荧光RT-PCR方法灵敏、特异、可靠,可用于PDCoV的临床检测和流行病学调查。

主 题 词:猪δ冠状病毒 实时荧光RT-PCR 快速检测 应用 

学科分类:090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

D O I:10.3969/j.issn.1005-944X.2022.11.021

馆 藏 号:203115480...

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