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基于非洲猪瘟病毒I177L和p72基因的双重TaqMan荧光定量PCR鉴别检测方法的建立

基于非洲猪瘟病毒I177L和p72基因的双重TaqMan荧光定量PCR鉴别检测方法的建立

作     者:曾繁聪 姜含雨 辛宁 柯骏鸿 罗瑞 何淑仪 张桂红 马春全 黄淑坚 陈耀 ZENG Fan-cong;JIANG Han-yu;XIN Ning;KE Jun-hong;LUO Rui;HE Shu-yi;ZHANG Gui-hong;MA Chun-quan;HUANG Shu-jian;CHEN Yao

作者机构:佛山科学技术学院生命科学与工程学院广东佛山528225 佛山国康检测技术有限公司广东佛山528225 华南农业大学兽医学院国家非洲猪瘟区域实验室(广州)广东广州510642 

基  金:广东省重点领域研发计划资助项目(2019B020211003) 佛山科学技术学院横向课题(KH22001) 

出 版 物:《中国预防兽医学报》 (Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine)

年 卷 期:2022年第44卷第9期

页      码:952-957页

摘      要:为建立一种可区分非洲猪瘟病毒(ASFV)野毒株和基因缺失疫苗株的荧光定量PCR方法,本研究根据ASFV HLJ/2018株(MK333180.1)I177L及p72基因序列,设计特异性引物及探针,经反应条件优化后建立一种双重Taq Man荧光定量PCR方法。绘制的标准曲线结果显示,两个重组质粒标准品p18T-I177L和p18T-p72相关系数R^(2)均在0.99以上,扩增效率E为88%~90%。表明两个重组质粒标准品的拷贝数均与各自的Ct值有良好的线性关系。特异性试验结果显示,该方法仅特异性扩增ASFV I177L和p72基因,对猪瘟病毒(CSFV)、猪圆环病毒2型(PCV2)、伪狂犬病毒(PRV)、猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪流行性腹泻病毒(PEDV)及猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)均无交叉反应;敏感性试验结果显示,该方法对p18T-I177L和p18T-p72质粒标准品的检测下限分别为4.63×10^(2)拷贝/μL和4.09×10^(2)拷贝/μL,敏感性较高;重复性试验结果显示,组内和组间重复性试验的变异系数均小于1.4%,重复效果好。分别利用该方法与ASFV荧光定量PCR检测试剂盒检测57份猪鼻拭子核酸样品,结果显示该方法检测出47份阳性核酸,10份阴性核酸样品。ASFV荧光定量试剂盒检测出46份阳性核酸,11份阴性核酸样品。二者的总符合率达94.7%,且二者的Kappa=0.825>0.75,P=1>0.05,表明两种方法无统计学差异且一致性良好。本研究建立的双重荧光定量PCR检测方法特异性强、敏感性高、重复性好,可用于ASFV的检测、鉴别检测和流行病学的调查研究。

主 题 词:非洲猪瘟病毒 双重荧光定量PCR 检测方法 

学科分类:090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

D O I:10.3969/j.issn.1008-0589.202201025

馆 藏 号:203115484...

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