白掌SSR引物筛选及12份种质资源亲缘关系分析

作     者：刘小飞 孙映波 黄丽丽 于波 Liu Xiaofei;Sun Yingbo;Huang Lili;Yu Bo

作者机构：广东省农业科学院环境园艺研究所广东省园林花卉种质创新综合利用重点实验室农业农村部华南都市农业重点实验室广州510640 

基　　金：广州市科技计划项目(202002020025) 广东省重点领域研发计划项目(2018B020202003) 广东省科技计划项目(2015B070701016)共同资助 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2022年第20卷第20期

页      码：6802-6810页

摘      要：本研究比较分析了白掌Spathiphyllum‘Parrish’转录组和叶绿体基因组中SSR标记的类型与分布,结果发现转录组中共有SSR标记7184个,其中,二核苷酸重复数量最多,为3454个;叶绿体基因组共有SSR标记281个,其中,单核苷酸重复数量最多,为223个。分别从转录组和叶绿体基因组的SSR标记中随机挑选32和18个,设计引物,PCR扩增后琼脂糖电泳结果显示,来自转录组的24对引物扩增条带清晰,多态性好;来自叶绿体基因组16对引物扩增条带清晰,多态性差。因此,选择来自转录组的24对引物合成M13标记的荧光引物,PCR扩增后毛细管电泳结果显示,19对引物共扩增出60个等位位点。利用60个等位位点构建了12份种质资源的系统进化树,UPGMA聚类分析将12份种质分为3组。19对引物中DN9090、24-DN9534、27-DN9108和DN101174对引物多态性较好,分别扩增出4、6、4和6个等位位点,可完全区分12份种质。本研究将为白掌种质资源鉴评提供可靠的SSR荧光标记引物。

主 题 词：白掌 简单重复序列 指纹图谱编码 种质资源 

学科分类：090706[090706] 0907[农学-草药学] 09[农学] 

D　O　I：10.13271/j.mpb.020.006802

馆 藏 号：203115525...