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面向抗乳腺癌候选药物拮抗雌激素受体α生物活性的定量构效关系模型构建

面向抗乳腺癌候选药物拮抗雌激素受体α生物活性的定量构效关系模型构建

作     者:吕婷婷 禹文韬 张慧琳 LYU Ting-ting;YU Wen-tao;ZHANG Hui-lin

作者机构:湖南中医药大学护理学院长沙410208 中南大学湘雅二医院长沙410011 中南大学自动化学院长沙410000 

基  金:湖南省卫生健康委2020年科研立项课题(No.20201035) 2021年度创新型省份建设专项科普专题立项项目(No.2021ZK4180) 

出 版 物:《中南药学》 (Central South Pharmacy)

年 卷 期:2022年第20卷第11期

页      码:2542-2548页

摘      要:目的 建立抗乳腺癌候选药物的分子描述符与该药物拮抗雌激素受体α(ERα)活性的定量构效关系(QSAR)预测模型,预测具有更好拮抗ERα活性的新药物分子或指导已有候选药物的结构优化。方法 使用某药物企业提供的乳腺癌ERα拮抗剂数据,首先通过改进的随机森林对化合物的分子结构描述符进行变量选择,选取前20个对生物活性具有显著影响的分子描述符;然后利用支持向量回归构建20个分子描述符对药物拮抗ERα活性的QSAR模型,再采用差分进化算法来优化模型的超参数。结果 数据经随机森林进行变量选择后从729个变量变为20个变量;对于药物拮抗ERα活性的基于支持向量回归的QSAR模型的拟合优度(R^(2))为0.7407,均方误差(MSE)为0.7034;而经过差分进化算法优化的QSAR模型对于药物拮抗ERα活性的R^(2)为0.935,MSE为0.1762。通过R^(2)和MSE的检验,优化后的模型具有较好的稳健性与较高的预测精度。结论 通过建立化合物分子描述符与其拮抗ERα活性的QSAR模型,找到对乳腺癌治疗药物的药物活性有重要影响的描述符,可用来指导乳腺癌新型治疗药物的设计。

主 题 词:乳腺癌 药物结构 定量构效关系 支持向量回归 差分进化算法 雌激素受体α 

学科分类:1007[医学-药学类] 1006[医学-中西医结合类] 100706[100706] 100602[100602] 10[医学] 

D O I:10.7539/j.issn.1672-2981.2022.11.015

馆 藏 号:203115527...

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