基于三代测序技术对中药灵芝和食用菌rRNA基因及其基因间序列的鉴定研究

作     者：张韦唯 袁育红 戈雅倩 朱彦蓉 赵解南 孙建鹤 黄林佳 胡泽华 许嘉豪 郭琳婷 高宇峰 张益辉 王燕萍 黄钢 王毅兴 戴方平 ZHANG Weiwei;YUAN Yuhong;GE Yaqian;ZHU Yanrong;ZHAO Jienan;SUN Jianhe;HUANG Linjia;HU Zehua;XU Jiahao;GUO Liting;GAO Yufeng;ZHANG Yihui;WANG Yanping;HUANG Gang;WANG Yixing;DAI Fangping

作者机构：江苏中方基因生物医学科技有限公司江苏南通226126 南通大学附属海门医院江苏南通226121 安徽中医药大学安徽合肥230012 江西中医药大学江西南昌330004 上海健康医学院上海200237 同济大学附属东方医院上海200120 长三角药学高等工程学院江苏南通226126 

基　　金：国家自然科学基金资助项目(81830052) 国家重点研发计划项目(2020YFA0909000) 上海市分子影像重点实验室建设项目(18DZ2260400) 上海市浦东新区中医治未病高峰学科建设项目(PDZY-2018-0603) 上海市浦东新区学科带头人项目(PWRd2019-04) 江苏省南通市科技局科技基金项目 

出 版 物：《上海中医药大学学报》 (Academic Journal of Shanghai University of Traditional Chinese Medicine)

年 卷 期：2022年第36卷第6期

页      码：5-12页

摘      要：目的:基于三代PacBio测序技术,建立中药灵芝和食用菌rRNA 18S-ITS-28S全长序列文库,从分子水平快速、准确鉴定和研究品种。方法:对收集到的8种食用菌和1种中药材真菌灵芝抽提基因组DNA,设计引物扩增18S-ITS-28S全长序列,18S-ITS-28S全长序列包括连续且完整的18S rRNA-ITS1-5.8S rRNA-ITS2和28S rRNA部分序列,其总长度>3.3 kb。将18S-ITS-28S全长序列进行建库和三代PacBio测序。结果:食用菌和药用灵芝的18S rRNA、5.8S rRNA及部分28S rRNA基因序列相似度高且序列保守,而rRNA基因间(ITS1和ITS2)的序列差异性大。结论:本研究的结果提示,分析rRNA基因间(ITSs)区域,而不是仅仅分析rRNA基因,有助于真菌类中药材的鉴定和研究。

主 题 词：灵芝 食用菌 rRNA基因 测序分析 鉴定 

学科分类：1008[医学-中药学类] 1006[医学-中西医结合类] 100602[100602] 10[医学] 

D　O　I：10.16306/j.1008-861x.2022.06.002

馆 藏 号：203115583...