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黄鳝微卫星标记筛选及其在不同性别表型群体中的遗传多态性

黄鳝微卫星标记筛选及其在不同性别表型群体中的遗传多态性

作     者:刘臻 罗小华 鲁双庆 匡刚桥 张建社 LIU Zhen;LUO Xiao-hua;LU Shuang-qing;KUANG Gang-qiao;ZHANG Jian-she

作者机构:长沙大学生物工程与环境科学系湖南长沙410003 

基  金:国家自然科学基金项目(30571414) 湖南省自然科学基金项目(06JJ20056) 湖南省教育厅重点项目(08A007) 

出 版 物:《江苏农业学报》 (Jiangsu Journal of Agricultural Sciences)

年 卷 期:2009年第25卷第2期

页      码:333-338页

摘      要:采用FIASCO(Fastisolation by AFLP sequences containing repeats)法进行黄鳝微卫星标记筛选并将其应用于黄鳝性别差异群体的遗传变异分析。黄鳝基因组DNA经酶切、微卫星核心序列探针杂交、T载体连接并转化至DH5a中,构建黄鳝基因组微卫星富集文库。随机挑选75个阳性克隆测序,结果发现其中20个含有微卫星序列,利用软件成功设计了15对微卫星引物,经过黄鳝基因组DNA的PCR扩增及电泳检测,筛选8对多态性微卫星引物并对黄鳝3种不同性别表型群体的基因组DNA进行PCR扫描,结果显示:在8个微卫星座位中,共检测到51个等位基因,平均每个座位的等位基因数为6.375个,等位基因频率分布为0.0012~0.6033;黄鳝雌性表型群体、间性表型群体、雄性表型群体的平均遗传杂合度分别为0.6371、0.6969、0.7345;平均多态信息含量分别为0.5656、0.6416、0.6858,表明这些微卫星标记在黄鳝不同性别表型群体的遗传多态性发生了改变,它们可作为黄鳝遗传背景分析的分子标记。

主 题 词:FIASCO 微卫星DNA 遗传多态性 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 07[理学] 071002[071002] 

D O I:10.3969/j.issn.1000-4440.2009.02.022

馆 藏 号:203115621...

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