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基于物种特异性PCR技术检测鼻疽诺卡菌和巴西诺卡菌的初步研究

基于物种特异性PCR技术检测鼻疽诺卡菌和巴西诺卡菌的初步研究

作     者:李芳 隗明 徐帅 岳苑 邱小彤 韩李超 陈胜林 刘雪萍 任明辉 李振军 LI Fang;WEI Ming;XU Shuai;YUE Yuan;QIU Xiao-tong;HAN Li-chao;CHEN Sheng-lin;LIU Xue-ping;REN Ming-hui;LI Zhen-jun

作者机构:西藏大学医学院拉萨850000 首都医科大学附属北京朝阳医院-北京市呼吸疾病研究所感染和临床微生物科北京102206 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室北京102206 宁夏大学西部特色生物资源保护与利用教育部重点实验室银川750021 山西医科大学太原030001 温州医科大学检验医学院检验医学教育部重点实验室温州325035 

基  金:国家重点研发计划(No.2019YFC1200700,No.2019YFC1200601-6,No.2021YFC2401000) 国家自然科学基金(No.82073624) 西藏大学研究生“高水平人才培养计划”项目(No.2020-GSP-S076) 

出 版 物:《中国人兽共患病学报》 (Chinese Journal of Zoonoses)

年 卷 期:2022年第38卷第12期

页      码:1045-1050页

摘      要:目的建立一种可以鉴别鼻疽诺卡菌和巴西诺卡菌的双重物种特异性PCR(species-specific Polymerase Chain Reaction,SS-PCR)诊断方法。方法基于鼻疽诺卡菌和巴西诺卡菌物种特异基因NFA_41530和O3I_RS18895分别设计特异性引物,通过优化反应条件和体系,建立快速准确的双重SS-PCR。对95株鼻疽诺卡菌、13株巴西诺卡菌和42株非目标菌株进行扩增,分析该方法的特异性和灵敏度,并通过模拟痰样本验证方法的准确性,预估其在临床诊断的价值。结果鼻疽诺卡菌和巴西诺卡菌质检分别扩增出一条清晰且单一的目标条带,其余42株非目标菌株均未扩增,表明该方法具有很好的特异性。该方法对鼻疽诺卡菌、巴西诺卡菌的检测下限分别为1.3×10^(4)copies/μL、2.4×10^(4)copies/μL,灵敏度较高。使用20个健康人的痰液模拟痰样本,检测符合率为100%。结论基于NFA_41530和O3I_RS18895基因建立的双重SS-PCR方法特异性强、灵敏度较高,是一种可以同时鉴定鼻疽诺卡菌和巴西诺卡菌的简便、快速、可靠、经济的方法。

主 题 词:鼻疽诺卡菌 巴西诺卡菌 物种特异性PCR 细菌鉴定 

学科分类:1007[医学-药学类] 100705[100705] 1001[医学-基础医学] 100103[100103] 10[医学] 

核心收录:

D O I:10.3969/j.issn.1002-2694.2022.00.158

馆 藏 号:203115749...

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