SNaPshot技术检测乙型肝炎病毒基因组P基因区单核苷酸多态性的研究

作     者：陈勇 余亚新 刘兴祥 魏来 CHEN Yong;YU Ya-xin;LIU Xing-xiang;WEI Lai

作者机构：江苏省淮安市第四人民医院淮安市肝病研究所223300 北京大学人民医院肝病研究所 

基　　金：江苏省卫生厅重点科研课题 (H2 0 0 118) 淮安市科技局重点科研课题 

出 版 物：《中华实验和临床病毒学杂志》 (Chinese Journal of Experimental and Clinical Virology)

年 卷 期：2005年第19卷第2期

页      码：162-164,i002页

摘      要：目的　建立SNaPshot技术对乙型肝炎病毒(HBV)基因组P基因区单核苷酸多态性(SNP)的分析。方法　针对HBVYMDD变异位置的上、下游设计引物,用PCR方法进行DNA扩增,产物直接测序或克隆测序。再针对变异位点74 1A G变异型(YVDD)和74 3G T变异型(YIDD)的紧邻上游设计高度特异的SNaPshot检测引物,用不同荧光标记的ddNTP对PCR产物进行一步延伸,然后置于310型DNA测序仪上观察荧光信号,可直观的检测上述两位点的单核苷酸多态性。结果　在拉米夫定治疗的慢性乙型肝炎患者中,经测序证实P基因区不仅存在74 1、74 3位点的变异,还存在5 14C A、5 2 3C A、5 6 2T A、6 6 7C A等位点的变异。对已证实P基因区变异的13例患者血清用SNaPshot技术检测YMDD结果与测序结果完全相同,显示SNaPshot技术高度的特异性。结论　SNaPshot技术检测HBV基因组SNPs具有快速、简便、准确特异的特点,还检测到野生株和变异株的混合存在。

主 题 词：乙型肝炎病毒基因组 技术检测 单核苷酸多态性(SNP) 乙型肝炎病毒(HBV) 慢性乙型肝炎患者 DNA测序仪 拉米夫定治疗 P基因区变异 YMDD DNA扩增 PCR方法 PCR产物 设计引物 克隆测序 直接测序 变异位点 荧光标记 SNPs 变异型 

学科分类：1002[医学-临床医学类] 1010[医学-医学技术类] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.3760/cma.j.issn.1003-9279.2005.02.018

馆 藏 号：203115802...