检疫性杂草毒莴苣EST-SSR标记的开发及应用

作     者：梁照文 童明龙 高振峰 张宝俊 伏建国 范晓虹 Liang Zhaowen;Tong Minglong;Gao Zhenfeng;Zhang Baojun;Fu Jianguo;Fan Xiaohong

作者机构：宜兴出入境检验检疫局江苏宜兴214206 山西农业大学农学院太谷030801 江苏出入境检验检疫局南京210095 中国检验检疫科学研究院北京100123 

基　　金：江苏检验检疫局科技计划(2012KJ56) 山西农业大学育种基金(2014YZ2-7) 山西省青年科技研究基金(2012021025-2) 

出 版 物：《植物保护学报》 (Journal of Plant Protection)

年 卷 期：2015年第42卷第4期

页      码：578-583页

摘      要：为明确毒莴苣EST序列中SSR的特点,并开发EST-SSR分子标记用于毒莴苣及其近似种的分类鉴定及遗传多样性分析,以筛选的7 438条毒莴苣EST序列为基础,利用SSRIT软件结合人工搜索查找SSR位点,并采用Primer Premier 5.0软件设计EST-SSR引物,以毒莴苣及其近似种为材料对所合成引物进行多态性检测,应用UPGMA法构建11个毒莴苣及其近似种的系统发育树。结果表明,共搜索到SSR位点1 465个,发现重复基元598种,其中二、三、六核苷酸重复是主要的重复类型。合成的24对引物中有9对表现出多态性,利用这9对EST-SSR引物分析毒莴苣等11份材料的亲缘关系,其相似性系数在0.432~1.000之间;于0.513处可被划分为3大类：Ⅰ类包括翅果菊和北山莴苣,Ⅱ类只有宿根莴苣1种,Ⅲ类包括毒莴苣和莴苣。

主 题 词：毒莴苣 近似种 EST-SSR 遗传多样性 

学科分类：09[农学] 0904[农学-动物医学类] 

核心收录：

D　O　I：10.13802/j.cnki.zwbhxb.2015.04.015

馆 藏 号：203115816...