鸭圆环病毒实时定量PCR检测方法的建立及流行毒株全基因组遗传变异分析

作     者：赵韵笛 杨兴淼 李靖红 曹瑞兵 ZHAO Yundi;YANG Xingmiao;LI Jinghong;CAO Ruibing

作者机构：南京农业大学动物医学院江苏南京210095 

基　　金：南京农业大学国家级SRT项目(2020(030)109Y) 江苏现代农业(水禽)产业技术体系疾病防控创新团队(JATS357) 

出 版 物：《畜牧与兽医》 (Animal Husbandry & Veterinary Medicine)

年 卷 期：2022年第54卷第12期

页      码：98-105页

摘      要：为了解近年来鸭圆环病毒(duck circovirus,DuCV)的流行现状,本研究在DuCV的Rep基因保守区内设计一对特异性荧光定量引物,建立SYBR Green I实时荧光定量PCR检测方法。结果显示:该方法最低可检测到拷贝数为3.46×10^(1)copies/μL的目的基因,比常规PCR灵敏;选取Ct值最低的阳性样品进行全基因组扩增及进化分析,成功扩增出1988 bp的病毒全基因,序列分析结果显示该病毒基因型为DuCV-1,亚型为1 b。本研究建立的实时荧光定量PCR检测方法为DuCV的流行病学调查提供了有效的监测手段,同时通过分析不同基因型的遗传进化特点与Cap蛋白氨基酸位点突变特征,为DuCV感染的防控研究提供参考。

主 题 词：鸭圆环病毒 基因进化 定量PCR 检测 

学科分类：090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

馆 藏 号：203115941...