连翘ARF基因家族的鉴定及生物信息学分析

作     者：栗谦 王帆 王淑晨 吴琼 杨雅琳 袁王俊 李永 LI Qian;WANG Fan;WANG Shuchen;WU Qiong;YANG Yalin;YUAN Wangjun;LI Yong

作者机构：河南农业大学林学院河南郑州450002 河南大学药学院河南开封475001 河南农业大学风景园林与艺术学院河南郑州450002 

基　　金：国家自然科学基金项目(31770225) 

出 版 物：《石河子大学学报（自然科学版）》 (Journal of Shihezi University(Natural Science))

年 卷 期：2022年第40卷第6期

页      码：719-728页

摘      要：本研究基于连翘[Forsythia suspensa(Thunb.) Vahl]基因组鉴定了连翘ARF(Auxin Response Factor)基因家族成员,并对FsARF基因进行生物信息学分析与功能预测。利用生物信息学的方法,对FsARF基因家族成员的基本性质、染色体定位、进化树、基因结构、结构域、顺式作用元件、不同组织表达模式进行分析。共鉴定出35个FsARF基因(FsARF1-35),它们在染色体上均有分布,其中3个分别分布在未挂载的片段,FsARF基因可分为5个亚族。35个ARF基因编码的蛋白质由326~1086 aa组成,连翘ARF基因编码的35个蛋白均为亲水性蛋白,其亚细胞定位在细胞核内。FsARF蛋白的二级结构主要由无规则卷曲构成。35个FsARF蛋白均含有DBD、Auxin_resp结构域,其中20个含有CTD结构域。35个FsARF基因启动子顺式作用元件与植物激素、生长发育、防御与胁迫、次级代谢产物合成相关。FsARF基因在不同组织部位差异表达。FsARF基因在植物生长发育过程中、应对激素与非生物胁迫时起着重要调控作用,其中FsARF2可能对花生长发育,FsARF6、FsARF14对果实发育起着重要调控作用。

主 题 词：连翘 ARF基因家族 蛋白结构域 基因组 

学科分类：090706[090706] 0907[农学-草药学] 09[农学] 

D　O　I：10.13880/j.cnki.65-1174/n.2022.23.014

馆 藏 号：203115977...