粉尘螨多态性微卫星标记的开发与评价

作     者：王慧慧 方惟希 王铎 刘艺 李咏琪 李幸蓉 陈子健 叶长江 孙恩涛 WANG Huihui;FANG Weixi;WANG Duo;LIU Yi;LI Yongqi;LI Xingrong;CHEN Zijian;YE Changjiang;SUN Entao

作者机构：皖南医学院临床医学院安徽芜湖241002 皖南医学院检验学院安徽芜湖241002 

基　　金：国家自然科学基金项目(31870352) 

出 版 物：《皖南医学院学报》 (Journal of Wannan Medical College)

年 卷 期：2022年第41卷第6期

页      码：598-601页

摘      要：目的:开发粉尘螨基因组微卫星标记,为粉尘螨种群遗传多态性和遗传分化提供有效的分子标记。方法:基于Illumina HiSeq TM平台进行粉尘螨全基因组测序,用MISA识别微卫星序列,Primer5设计引物,并进行PCR扩增。选择易扩增、稳定性高的引物,应用毛细管电泳法对3个种群共15个个体进行遗传多样性分析,以评价所开发微卫星标记的效果。结果:在粉尘螨基因组中筛选到266个候选微卫星标记,通过毛细管电泳再筛选得到12对微卫星标记。用12对引物对3个种群共15个个体进行遗传多样性分析。结果表明,12个标记共有66个等位基因,每个标记等位基因数为3~9,观测杂合度和期望杂合度分别为0.133~0.800和0.291~0.793。各标记的香农指数I为0.563~1.807。各标记的多态性信息含量PIC为0.271~0.765,8个位点为高度多态性标记,其余为中度多态性标记。结论:本研究开发出的微卫星标记准确可靠,多态性高,可应用于粉尘螨的遗传多样性分析。

主 题 词：粉尘螨 微卫星 分子标记 遗传多样性 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 1001[医学-基础医学] 07[理学] 100103[100103] 071007[071007] 10[医学] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1002-0217.2022.06.024

馆 藏 号：203116201...