彩色马铃薯查尔酮合酶基因的克隆及生物信息学分析

作     者：聂利珍 李晓东 谢锐 房永雨 Nie Lizhen;Li Xiaodong;Xie Rui;Fang Yongyu

作者机构：内蒙古自治区农牧业科学院呼和浩特010031 内蒙古自治区农牧业科学院内蒙古自治区甜菜品种遗传改良与种质创制重点实验室呼和浩特010031 内蒙古自治区农牧业科学院内蒙古自治区植物蛋白质组学重点实验室呼和浩特010031 

基　　金：内蒙古自治区自然科学基金项目(2018LH03001)资助 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2022年第20卷第23期

页      码：7679-7686页

摘      要：为了研究彩色马铃薯块茎中花色苷积累的分子机制,明确查尔酮合成酶(CHS)在花色苷合成途径中作用,本研究以彩色马铃薯品种‘红美’块茎作为实验材料,根据GenBank数据库中已注册马铃薯CHS基因的cDNA序列设计引物,通过RT-PCR方法克隆了一个CHS基因,命名为StCHS1b。StCHS1b基因cDNA序列共1 223 bp,开放阅读框为1 170 bp,编码389个氨基酸。分子质量约为42.48 kD,理论等电点为6.3。生物信息学分析表明,该蛋白为亲水性的稳定蛋白质,而且含有CHS家族序列标签的保守区域GVLFGFGPGLT,无信号肽,不含有跨膜区。Blastn分析表明,StCHS1b基因序列与其他物种的CHS基因序列均具有较高同源性,编码区氨基酸相似性高达99%。进化分析表明,彩色马铃薯StCHS1b与番茄SlCHS、茄子Sm CHS、辣椒CaCHS、烟草NtCHS和黑果枸杞LrCHS聚在同一个分支,都属于茄科,它们的亲缘关系最近,与苹果MdCHS和覆盆子RiCHS亲缘关系较远。

主 题 词：彩色马铃薯 查尔酮合成酶基因 基因克隆 生物信息学分析 

学科分类：09[农学] 0901[农学-植物生产类] 

D　O　I：10.13271/j.mpb.020.007679

馆 藏 号：203116207...