基因微矩阵技术在骨肉瘤发病相关基因研究中的应用

作     者：李国东 蔡郑东 陈正军 卢雪峰 雷会宁 郑龙坡 

作者机构：第二军医大学附属长海医院骨科上海200433 中科院上海生化细胞研究所 

基　　金：国家自然科学基金资助项目(30170955) 

出 版 物：《中华实验外科杂志》 (Chinese Journal of Experimental Surgery)

年 卷 期：2005年第22卷第9期

页      码：1094-1097页

摘      要：目的探索骨肉瘤发病相关基因,研究基因表达水平对于骨肉瘤发病的重要意义。方法采用3个公认的骨肉瘤细胞株及1个成骨细胞株,提取总RNA,合成生物素标记的cRNA与AffymetrixGeneChipU133A芯片杂交。随机挑选10个差异表达基因,分别设计合成引物,用嵌合荧光法(SYBRGreenI)实时RTPCR法定量测量9例术中收集的新鲜骨肉瘤标本中各基因的表达水平,应用ABIPrism7000分析其与成骨细胞株之间的表达差异。结果以表达差异≥2.0倍为限,在AffymetrixHGU133A芯片包含的所有基因(约22000个转录本)中,3个骨肉瘤细胞株与成骨细胞株相比较,共同上调58个基因;共同下调142个基因。随机挑选10个差异表达基因的实时RTPCR结果与芯片结果完全相符。结论骨肉瘤是一种多基因病变,应用微矩列有助于发现该肿瘤的基因变化规律以及研究肿瘤内基因与基因的相互作用关系。

主 题 词：骨肉瘤 基因 骨肉瘤细胞株 相关基因研究 基因微矩阵 Affymetrix 发病 GeneChip 基因表达水平 差异表达基因 

学科分类：1002[医学-临床医学类] 100214[100214] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.3760/j.issn:1001-9030.2005.09.026

馆 藏 号：203116238...