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用MXAN拟合钩端螺旋体去甲酰化酶XANES谱

用MXAN拟合钩端螺旋体去甲酰化酶XANES谱

作     者:郭晓云 储旺盛 龚为民 董宇辉 谢亚宁 杨飞飞 Maurizio Benfatto 吴自玉 GUO Xiao-Yun;CHU Wang-Sheng;GONG Wei-Min;DONG Yu-Hui;XIE Ya-Ning;YANG Fei-Fei;Maurizio Benfatto;WU Zi-Yu

作者机构:中国科学技术大学生命科学学院 中国科学院高能物理研究所 中国科学院生物物理所 Instituto Nazionale di Fisica Nucleare Laboratori Nazionali di FrascatiP.O.Box 1300044FrascatiItaly) 

基  金:杰出青年基金(10125523) 国家自然科学基金重大交叉研究项目(10490191 10490193)资助~~ 

出 版 物:《高能物理与核物理》 (High Energy Physics and Nuclear Physics)

年 卷 期:2007年第31卷第2期

页      码:199-203页

摘      要:钩端螺旋体去甲酰化酶(Leptospira interrogans PDF)是一种重要的含锌金属蛋白酶,对钩端螺旋体这一广泛存在的致病菌的蛋白合成起着关键的催化作用,是一个很好的药物设计靶蛋白.本文测试了LiPDF在pH3.0的溶液状态下的X射线吸收近边结构(XANES:X-Ray Absorption Near-Edge Structure)谱,利用以从头计算(***)的多重散射(Multiple Scattering)为基础的MXAN方法确定金属蛋白活性中心的精细结构.研究发现结合合适的初始结构模型,可以更好地重现LiPDF蛋白的XANES曲线,从而能够得到更加准确的结构参数.活性中心的精细结构为理解LiPDF的pH依赖的催化活性提供了结构基础.

主 题 词:钩端螺旋体去甲酰化酶 金属蛋白 XANES MXANN程序包 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 071010[071010] 07[理学] 0827[工学-食品科学与工程类] 0805[工学-能源动力学] 0704[理学-天文学类] 0702[理学-物理学类] 

核心收录:

D O I:10.3321/j.issn:0254-3052.2007.02.014

馆 藏 号:203116277...

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