绵羊FGF5基因编码蛋白的生物信息学分析

作     者：刘伍限 贾斌 石国庆 LIU Wuxian;JIA bin;SHI Guoqing

作者机构：石河子大学动物科技学院石河子832003 新疆农垦科学院石河子832000 

基　　金：农业部转基因生物新品种培育科技重大专项(2009ZX08008-001B) 

出 版 物：《石河子大学学报（自然科学版）》 (Journal of Shihezi University(Natural Science))

年 卷 期：2011年第29卷第3期

页      码：296-300页

摘      要：为了应用生物信息学分析绵羊FGF5基因编码蛋白的结构与抗原表位,预测该蛋白的免疫原性。根据牛的FGF5基因cDNA保守区序列设计引物对绵羊FGF5基因cDNA进行扩增,将扩增片段进行克隆和测序,并与牛的FGF5基因序列进行同源性比较,确定扩增的片段为绵羊FGF5基因片段。利用蛋白分析专家系统(ExPASy)提供的ProtParam、SOSUI、MotifScan、SWISS-MODEL等生物信息学在线分析程序,结合TMH-MM2.0、SignalP3.0、TargetP 1.1和PSORTⅡprediction、Gene Runner和DNAMAN等生物信息学软件,分析、预测FGF5蛋白的理化性质、可溶性、翻译后修饰位点、亲(疏)水性、跨膜区、信号肽序列、蛋白细胞定位区域、二级结构、抗原表位等。结果显示该蛋白由270个氨基酸组成,分子式C1315H2085N389O378S6,分子质量单位为29.5847 ku,理论等电点为10.59,波长280 nm时的吸光度(A)值为0.864,半衰期为30 h,22个翻译后修饰位点、多个亲水性高的区域、2个跨膜区域、11个潜在抗原表位,为可溶性和分泌型蛋白,具有免疫原性,可据此制备多克隆抗体。

主 题 词：绵羊 FGF5基因 蛋白质结构 生物信息学 抗原表位 

学科分类：0905[农学-林学类] 09[农学] 090501[090501] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1007-7383.2011.03.008

馆 藏 号：203117239...