北京黑猪HoxB簇基因多态性与脊椎数及胴体性状的关联分析

作     者：牛乃琪 苏艳芳 杨曼 侯欣华 王立刚 张龙超 NIU Naiqi;SU Yanfang;YANG Man;HOU Xinhua;WANG Ligang;ZHANG Longchao

作者机构：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100193 

基　　金：国家重点研发计划项目(2021YFD1301101) 国家生猪产业技术体系(CARS-35) 中国农业科学院科技创新工程(CAAS-ZDRW202006-04) 

出 版 物：《畜牧兽医学报》 (ACTA VETERINARIA ET ZOOTECHNICA SINICA)

年 卷 期：2023年第54卷第1期

页      码：113-121页

摘      要：旨在对北京黑猪HoxB簇9个基因(HoxB1-7、9和13)的多态性与脊椎数和胴体性状(胴体长、胴体直长、胴体斜长及胴体重)进行关联分析。本研究提取251头220日龄的健康北京黑猪耳组织DNA,对HoxB簇的9个基因通过引物设计、聚合酶链式反应(PCR)技术、Sanger测序技术等对SNPs进行基因分型,并计算变异位点基因型频率以及等位基因频率分布,并与脊椎数和胴体性状进行关联分析。结果,本试验共筛选到4个基因共12个非编码区的(UTR)SNPs,包括HoxB2基因的1个5′UTR突变、HoxB5基因的2个3′UTR突变、HoxB9基因的2个3′UTR突变以及HoxB13基因的7个3′UTR突变。将12个SNPs分别与脊椎数和胴体性状使用Duncan′s多重检验统计分析发现,HoxB2基因的1个5′UTR突变(c.40 C>T)、HoxB5基因的2个3′UTR突变(c.1766 A>G、c.1767 A>G)均与性状关联不显著(P>0.05);而HoxB9基因中的1个3′UTR突变(c.2743 C>T)与胴体性状关联显著(PA、c.1440 A>C)与脊椎数关联显著(PT与胴体性状关联显著(PA、c.1440 A>C均与脊椎数性状关联显著(P<0.05),这3个位点可作为北京黑猪脊椎数及胴体性状变异的候选基因功能位点。

主 题 词：北京黑猪 HoxB9 HoxB13 脊椎数 胴体性状 

学科分类：0905[农学-林学类] 09[农学] 090501[090501] 

核心收录：

D　O　I：10.11843/j.issn.0366-6964.2023.01.011

馆 藏 号：203117822...