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基于无细胞体系的生物合成代谢模块设计、构建与快速途径原型

基于无细胞体系的生物合成代谢模块设计、构建与快速途径原型

作     者:唐士茗 胡纪元 郑穗平 韩双艳 林影 TANG Shiming;HU Jiyuan;ZHENG Suiping;HAN Shuangyan;LIN Ying

作者机构:华南理工大学生物科学与工程学院广东广州510006 

基  金:国家重点研发计划(2018YFA0901700) 

出 版 物:《合成生物学》 (Synthetic Biology Journal)

年 卷 期:2022年第3卷第6期

页      码:1250-1261页

摘      要:随着代谢工程及合成生物学技术的发展,化学品高效生物合成与绿色制造成为可能。高效生物合成体系的设计与构建是绿色生物制造的核心,其理论体系建立及关键技术突破,将为实现绿色生物制造领域高效生产及资源与环境可持续发展提供有力支撑。本文借助代谢途径模块设计的案例,探讨化合物生物合成过程中潜在通用模块设计原则、设计工具,以及基于无细胞蛋白合成体系的代谢模块快速构建及测试的方法,将突破生物合成途径多基因、多模块“设计-构建-测试”(Design-Build-Test cycle,DBT cycle)高效循环迭代的技术瓶颈。结合机器学习方法的应用,将使“设计-构建-测试”向“设计-构建-测试-学习”(Design-Build-Test-Learn cycle,DBTL cycle)进一步延伸,对高效合成模块的“精准-鲁棒性”设计与构建、推动合成生物学科学与技术发展具有重要意义。

主 题 词:生物合成模块 无细胞蛋白合成 无细胞快速原型 机器学习 

学科分类:08[工学] 09[农学] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

D O I:10.12211/2096-8280.2022-024

馆 藏 号:203118060...

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