新冠病毒核衣壳蛋白结构与功能的生物信息学分析及原核表达

作     者：徐本锦 范蕾 杜淼 宣焱 李璟 李卓禧 陈晓聪 吴惠文 门杰 刘玲 杨娅男 汤文婷 寇妍祺 余骏骁 XU Benjin;FAN Lei;DU Miao;XUAN Yan;LI Jing;LI Zhuoxi;CHEN Xiaocong;WU Huiwen;MEN Jie;LIU Ling;YANG Yanan;TANG Wenting;KOU Yanqi;YU Junxiao

作者机构：山西医科大学汾阳学院医学检验系汾阳032200 山西医科大学汾阳学院基础医学部汾阳032200 山西医科大学汾阳学院科技中心汾阳032200 

基　　金：山西省高等学校科技创新项目(2020L0749) 国家级大学生创新创业训练计划项目(202117114001) 山西省高等学校大学生创新创业训练计划重点项目(S202117114008) 山西医科大学汾阳学院引进人才启动金项目(2020A01) 山西医科大学汾阳学院大学生创新创业训练计划项目(FDC202111)资助 吕梁市科技计划项目(2020SHFZ29,2020XGZX104) 

出 版 物：《中国免疫学杂志》 (Chinese Journal of Immunology)

年 卷 期：2022年第38卷第24期

页      码：2963-2970,I0001,I0002页

摘      要：目的:对SARS-CoV-2核衣壳(N)蛋白进行系统生物信息学分析和原核表达,阐明其功能和病毒RNA复制机制。方法:采用UniProt、NetPhos 3.1、IEDB和Blast等生物信息学软件对N蛋白的理化性质、蛋白互作网络、翻译后修饰、同源性及系统进化关系等生物学特性进行系统分析。构建原核表达质粒pET-22b-N并表达蛋白。结果:N蛋白是由419个氨基酸组成的碱性蛋白,分子量为45.62 kD,等电点为10.07,其N端有1个RNA结合结构域,C端有1个二聚体界面,有57个可能的磷酸化修饰和25个潜在糖基化修饰,15个T细胞抗原表位和11个线性B细胞抗原表位,无信号肽和跨膜螺旋,是一种亲水性蛋白。N蛋白中无规则卷曲占比最高(54.42%),其次为α-螺旋(22.20%)。与N蛋白序列一致性最高的是BtRs-β-冠状病毒/HuB2013和蝙蝠冠状病毒Rp/Shaanxi2011,进化分析显示SARS-CoV-2与蝙蝠非典型冠状病毒YNLF_31C聚为一支。原核表达后发现,细菌裂解液离心后的沉淀中有大量N蛋白表达,为后续蛋白纯化和结构分析提供了依据。结论:N蛋白在SARS冠状病毒和蝙蝠冠状病毒间高度保守,为SARS-CoV-2 N蛋白结构与功能研究提供了基础,为靶向N蛋白的抗病毒药物设计提供了依据。

主 题 词：新冠病毒 核衣壳蛋白 生物信息学分析 载体构建 原核表达 

学科分类：08[工学] 09[农学] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

核心收录：

D　O　I：10.3969/j.issn.1000-484X.2022.24.004

馆 藏 号：203118080...