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月季TIFY基因家族的全基因组分析

月季TIFY基因家族的全基因组分析

作     者:王昊宁 周佩 刘燕 刘梦 朱晓仪 石力匀 栗燕 逯久幸 WANG Haoning;ZHOU Pei;LIU Yan;LIU Meng;ZHU Xiaoyi;SHI Liyun;LI Yan;LU Jiuxing

作者机构:河南农业大学风景园林与艺术学院河南郑州450002 河南省优质花卉蔬菜种苗工程技术中心河南郑州450002 

基  金:国家自然科学基金项目(32201615) 河南省教育厅重点科研项目(22A220001) 

出 版 物:《河南农业大学学报》 (Journal of Henan Agricultural University)

年 卷 期:2022年第56卷第6期

页      码:990-997,1060页

摘      要:【目的】研究TIFY基因家族在月季(Rosa chinensis Jacq.)干旱胁迫与盐胁迫发生过程中的作用。【方法】利用生物信息学方法对月季TIFY家族成员进行全基因组鉴定、系统进化树分析、理化性质分析、染色体定位分析、基因共线性分析和基因结构分析,并结合转录组表达数据以及顺式元件分析筛选与盐胁迫、干旱胁迫响应相关的基因。【结果】鉴定了13个月季TIFY家族成员;通过与拟南芥、水稻共同构建的进化树,将这些成员分为4个亚家族;这些成员分布在5条染色体上,与拟南芥同源性更高;各亚家族特征结构域完整。其中6个RcTIFY成员在干旱胁迫和盐胁迫中发挥着积极作用;顺式元件结果表明,大多数RcTIFY成员可能参与了脱落酸与茉莉酸甲酯的响应。积极响应干旱胁迫或盐胁迫的TIFY家族成员RcTIFY5a、RcTIFY5b、RcTIFY6a、RcTIFY6b、RcTIFY10b均含有丰富的脱落酸、茉莉酸甲酯响应元件。【结论】月季中有13个RcTIFY基因,多个成员在干旱胁迫和盐胁迫响应中发挥着积极作用,脱落酸和茉莉酸甲酯是该家族成员的潜在调控激素。

主 题 词:TIFY基因家族 生物信息学 干旱胁迫 盐胁迫 脱落酸 茉莉酸甲酯 

学科分类:090706[090706] 0907[农学-草药学] 09[农学] 

D O I:10.16445/j.cnki.1000-2340.20221007.001

馆 藏 号:203118163...

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