牦牛Agouti基因的克隆及编码区多态性研究

作     者：张建一 梁春年 吴晓云 张良斌 郭宪 裴杰 阎萍 ZHANG Jian-yi;LIANG Chun-nian;WU Xiao-yun;ZHANG Liang-bin;GUO Xian;PEI Jie;YAN Ping

作者机构：甘肃农业大学动物科学技术学院甘肃兰州730070 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所甘肃省牦牛繁育重点实验室甘肃兰州730050 

基　　金：国家科技支撑计划项目(2012BAD13B05) 国家公益性行业科研项目(201003061) 

出 版 物：《华北农学报》 (Acta Agriculturae Boreali-Sinica)

年 卷 期：2014年第29卷第5期

页      码：59-65页

摘      要：以Agouti基因作为牦牛毛色调控的候选基因,探索Agouti基因编码区序列多态性,以期为阐明Agouti与毛色形成的相关性及毛色形成机理奠定基础。根据GenBank已发表序列(NM_206843)设计1对引物,以天祝白牦牛和黑色被毛甘南牦牛皮肤总RNA为模板,采用RT-PCR技术扩增,成功获得了牦牛Agouti基因编码区序列。采用生物信息学方法预测分析Agouti基因及其编码蛋白的基本理化性质、信号肽、疏水性、二级结构等;采用DNA混合池测序法和直接测序法,检测牦牛Agouti基因编码区的序列变异。结果表明,扩增得到的Agouti基因的编码区是一条长为593 bp的DNA序列。黑色甘南牦牛和天祝白牦牛皮肤的Agouti基因序列相同,并与黄牛基本一致。将牦牛的Agouti基因序列命名为YAK ASIP,并且在NCBI数据库中注册该基因的登录号为KJ630463。该基因含有一个长度为402 bp的开放性阅读框,编码133个氨基酸。Agouti基因编码蛋白属于亲水性蛋白,有一个明显的信号肽,含有多个磷酸化位点。其二级结构主要以α螺旋和无规则卷曲为主。Agouti基因编码产物氨基酸邻接系统树表明,牦牛Agouti与黄牛、绵羊等物种的Agouti氨基酸具有高度相似性,并且牦牛Agouti基因编码区中无多态性位点。

主 题 词：牦牛 Agouti基因 克隆 生物信息学分析 多态性 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

核心收录：

D　O　I：10.7668/hbnxb.2014.05.011

馆 藏 号：203118165...