基于花脸香蘑基因组的SSR分子标记开发

作     者：李雪松 华蓉 孙达锋 岳万松 尚陆娥 刘绍雄 LI Xuesong;HUA Rong;SUN Dafeng;YUE Wansong;SHANG Lu′e;LIU Shaoxiong

作者机构：中华全国供销合作总社昆明食用菌研究所云南昆明650221 云南省食用菌产业发展研究院云南昆明650221 

基　　金：云南省重大科技专项计划资助项目(202002AE320003) 云南省科技人才与平台计划资助项目(202005AE160001) 

出 版 物：《北方园艺》 (Northern Horticulture)

年 卷 期：2023年第2期

页      码：112-120页

摘      要：以4个花脸香蘑菌株及已公布的花脸香蘑基因组为试材,采用生物信息学和试验验证相结合的方法,研究了花脸香蘑基因组上的SSR类型及分布,设计了50对SSR引物开展试验验证,以期为花脸香蘑的种质资源鉴定、品种选育、分子标记辅助育种等研究提供参考依据。结果表明:总计检索到7种SSR类型的2486条序列,其中主要以单碱基(P1)类型为主,占总SSR的67.70%,且分布密度较高;四、五、六碱基重复的类型较多,但数量较少。由验证试验获得4对多态性高、重复性好、特异性好的引物,分别为HLMSSR001、HLMSSR004、HLMSSR015和HLMSSR041。其中,HLMSSR001和HLMSSR004可以通过单一的引物扩增即可将4个花脸香蘑菌株进行区分鉴定。同时,基于4对引物进行花脸香蘑DNA指纹编码的构建,获得了4个花脸香蘑菌株唯一的8位数分子指纹数据库编码。

主 题 词：花脸香蘑 基因组 SSR 标记开发 

学科分类：09[农学] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 090202[090202] 

D　O　I：10.11937/bfyy.20222019

馆 藏 号：203118174...