鸡ITGB1基因生物信息学分析

作     者：贾羽晴 夏晶晶 薛百玲 税斐 曹程程 丁元飞 张泰康 耿照玉 金四华 JIA Yuqing;XIA Jingjing;XUE Bailing;SHUI Fei;CAO Chengcheng;DING Yuanfei;ZHANG Taikang;GENG Zhaoyu;JIN Sihua

作者机构：安徽农业大学动物科技学院安徽合肥230036 

基　　金：国家自然科学基金项目(31802028) 安徽高校优秀青年人才支持重点项目(gxyqZD2022017) 安徽省教育厅高校自然科学研究重点项目(2022AH050928) 广东省动物分子设计与精准育种实验室开放课题(2019B01) 安徽省重点研究与开发计划项目(202004a06020049) 

出 版 物：《华北农学报》 (Acta Agriculturae Boreali-Sinica)

年 卷 期：2022年第37卷第S01期

页      码：339-347页

摘      要：利用生物信息学方法分析鸡ITGB1基因结构及其编码蛋白理化性质,结构位点及细胞定位等,旨在进一步探究该基因功能与潜在用途。同时从GenBank中下载鸡、鹅、鸭、火鸡、人、猪、兔、小鼠、大鼠、绵羊、黑猩猩11个物种的ITGB1基因CDS序列为材料,对该11个物种的ITGB1蛋白序列进行同源性和系统进化分析。结果表明,该基因CDS区长度为2412 bp,共编码803个氨基酸,其相对分子质量为88618.48,理论等电点为5.14;其是一个亲水性的稳定蛋白,有信号肽;蛋白二级结构上,含有162个α-螺旋,459个无规则卷曲,182伸展条和一个跨膜结构。鸡ITGB1基因的编码蛋白经同源性比对,发现其与鹅、火鸡、鸭的ITGB1蛋白高度同源。利用生物信息学方法对ITGB1基因及其表达的蛋白进行研究,有助于理解该基因在鸡这一物种上的相关作用,为进一步开发利用鸡ITGB1基因进行禽业生产、禽病防控以及分子育种提供了参考依据。

主 题 词：鸡 ITGB1基因 生物信息学分析 同源性 

学科分类：0905[农学-林学类] 09[农学] 090501[090501] 

核心收录：

D　O　I：10.7668/hbnxb.20193360

馆 藏 号：203118259...