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欧李ChUFGT基因的克隆、生物信息学分析及亚细胞定位

欧李ChUFGT基因的克隆、生物信息学分析及亚细胞定位

作     者:王迪 成冠超 祝利伟 刘宇涵 笈小龙 宋兴舜 Wang Di;Cheng Guanchao;Zhu Liwei;Liu Yuhan;Ji Xiaolong;Song Xingshun

作者机构:东北林业大学生命科学学院哈尔滨150040 

基  金:科技基础资源调查专项(2019FY100502-5) 东北林业大学国家级大学生创新训练项目(202010225037)共同资助 

出 版 物:《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期:2023年第21卷第3期

页      码:782-788页

摘      要:为从分子水平上揭示欧李中3-O-类黄酮葡萄糖基转移酶(UFGT)基因的空间表达情况,以欧李叶片为试材,根据欧李的转录组序列设计特异性引物,通过PCR获得ChUFGT基因序列,并进行生物信息学分析及亚细胞定位分析。结果表明,ChUFGT基因DNA开放阅读框为1425 bp(不含终止子),相对分子质量为51.63 kD,编码475个氨基酸,其对应的蛋白质是带正电荷的稳定疏水性蛋白。与近缘物种的蛋白质序列比对分析显示,欧李、李和樱桃李的UFGT氨基酸序列相似度达到97.22%和96.62%,整个系统发育树存在两个大分支,其中ChUFGT与同科植物的亲缘关系最近,其次是与白梨、西洋梨、荔枝等其他科植物相对较近,与葡萄、刺葡萄、石榴等植物的亲缘关系最远。ChUFGT的亚细胞定位结果分析显示,在洋葱内表皮细胞的细胞核和细胞质中都表达该基因。本研究结果为进一步阐明ChUFGT调控欧李细胞花色素苷的合成机制提供了理论基础。

主 题 词:欧李(Cerasus humilis) UFGT基因 基因克隆 生物信息学分析 亚细胞定位 

学科分类:09[农学] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 090201[090201] 

D O I:10.13271/j.mpb.021.000782

馆 藏 号:203118260...

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