HIV-1整合酶与L708,906抑制剂结合模式及运动性的研究

作     者：胡建平 刘嵬 唐典勇 张元勤 常珊 HU Jian-Ping1),LIU Wei2),TANG Dian-Yong1),ZHANG Yuan-Qin1),CHANG Shan3)(1) Molecular Design Center,Life and Chemistry College,Leshan Normal University,Leshan 614004,China;2) Key Laboratory of Medicinal and Edible Plants Resources Development,Chengdu University,Chengdu 610106,China;3) College of Informatics,South China Agricultural University,Guangzhou 510642,China)

作者机构：乐山师范学院化学与生命科学学院分子设计中心乐山614004 成都大学药食同源植物资源开发重点实验室成都610106 华南农业大学信息学院广州510642 

基　　金：四川省教育厅基金(08ZB054) 四川省中医药管理局科技专项基金(201003)资助项目~~ 

出 版 物：《生物化学与生物物理进展》 (Progress In Biochemistry and Biophysics)

年 卷 期：2011年第38卷第4期

页      码：338-346页

摘      要：前期工作已用分子对接方法获得了HIV-1整合酶与L708,906抑制剂分子的复合物模型(IN_L708,906),现从距离、能量和氢键三个方面详细地分析了IN_L708,906模型中的关键残基.结果表明,复合物模型与蛋白质晶体库中整合酶(IN)与5CITEP的结合模式相近.用主成分分析和动力学交叉相关图方法分别研究了IN_L708,906复合物模型和IN单体的运动模式及相关性差异.计算结果显示,L708,906抑制剂的结合使得IN功能loop区残基柔性下降、分子规律性运动的丧失及集团运动相关性的无序增加,这些可能是酶活性下降的主要因素.模拟结果将有利于基于芳香二酮酸类的抗HIV药物设计.

主 题 词：整合酶 L708 906 运动模式 运动相关性 药物设计 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 0831[工学-公安技术类] 071010[071010] 081704[081704] 07[理学] 070304[070304] 08[工学] 0817[工学-轻工类] 0703[理学-化学类] 

核心收录：

D　O　I：10.3724/SP.J.1206.2010.00438

馆 藏 号：203118387...