猪戊型肝炎病毒荧光定量PCR检测方法的建立及其分子流行病学

作     者：张晓峰 帅江冰 李爱云 方维焕 何永强 吴珊 ZHANG Xiao-feng;SHUAI Jiang-bing;LI Ai-yun;FANG Wei-huan;HE Yong-qiang;WU Shan

作者机构：浙江出入境检验检疫局浙江杭州310012 浙江大学医学院附属妇产科医院浙江杭州310006 浙江大学动物预防医学研究所浙江杭州310029 

基　　金：浙江省国境安全检验检疫科技创新服务平台资助项目(2006C17014) 浙江出入境检验检疫局科技基金资助项目(ZK200611) 

出 版 物：《中国兽医学报》 (Chinese Journal of Veterinary Science)

年 卷 期：2011年第31卷第6期

页      码：822-827页

摘      要：对已发表的戊型肝炎病毒(HEV)不同基因型毒株全序列进行分析,针对ORF3的保守区设计引物和探针优化建立了HEV荧光RT-PCR检测体系。分析表明该反应体系具有良好的扩增效率、特异性和稳定性,且检测灵敏度比普通RT-PCR方法高10～100倍。利用所建立的荧光定量PCR方法对采集自浙江及其周边上海、江苏等地区规模化猪场的样品以及HEV抗体阳性人血清样品进行了HEV核酸检测。其中,77份人血清样本仅有2份为HEV核酸阳性(2.6%)。而猪粪便样品阳性率则高达20.5%(56/273),且所调查的猪场均存在HEV感染。进一步的分子流行特征分析表明,浙江及周边地区的猪HEV毒株多为基因Ⅳ型,与其他地区的Ⅳ型HEV毒株同源性较高(83.4%～89.5%),但它们之间也存在较多的变异位点。猪源HEV毒株PJ-1则与多数Ⅲ型HEV毒株同源性较高(88%),进化分析也表明其为基因Ⅲ型。人血清样品中检测到的2份HEV毒株Human-1与Human-2与本地区Ⅳ型猪源毒株在分子进化关系上具有很高的亲源性,它们分布于同一分支内,而不构成独立分支。以上分析结果表明浙江及其周边地区猪HEV感染较为广泛,且以基因Ⅳ型毒株为主,但也存在基因Ⅲ型毒株的流行。

主 题 词：戊型肝炎病毒 荧光定量PCR 基因型 分子进化 

学科分类：090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

核心收录：

D　O　I：10.16303/j.cnki.1005-4545.2011.06.033

馆 藏 号：203118423...