河北省猪星状病毒4型全基因组测定及遗传进化分析

作     者：王晶 陈少杰 张帅 刘莹 赵云环 王传文 李妍 左玉柱 范京惠 WANG Jing;CHEN Shaojie;ZHANG Shuai;LIU Ying;ZHAO Yunhuan;WANG Chuanwen;LI Yan;ZUO Yuzhu;FAN Jinghui

作者机构：河北农业大学、动物医学院河北保定071001 河北省兽医生物技术创新中心河北保定071001 

基　　金：河北省重点研发计划资助项目(21326611D,19226622D) 河北省农业产业技术体系生猪创新团队资助项目(HBCT2018110207) 

出 版 物：《中国兽医学报》 (Chinese Journal of Veterinary Science)

年 卷 期：2023年第43卷第1期

页      码：10-15页

摘      要：为了解河北省流行的猪星状病毒(PAstV)遗传特性和重组现象,设计了7对特异性扩增引物,利用RT-PCR方法进行全基因组序列扩增;应用DNAStar软件和MEGA 7.0软件对扩增得到的序列进行拼接和核苷酸同源性分析,并建立基于全基因组和ORF2基因的系统进化树;利用生物学分析软件对全基因组序列结构特点和重组现象进行分析。结果显示,成功扩增得到1株PAstV4 HB-SJZ全基因组序列;全基因组遗传分析显示,HB-SJZ株与PAstV4参考毒株同源性显著高于其他基因型毒株,为74.2%~81.0%,与匈牙利4型毒株WBAstV-1同源性最高(81.0%);基于ORF2基因分析显示,HB-SJZ株与PAstV4参考毒株同源性为64.8%~68.9%,与日本毒株PoAstV-VIRES-GX03-C3遗传关系最近(68.9%);重组分析显示,HB-SJZ株的ORF1基因与JPN Bu52014株和JPN Mol2-32015株存在重组现象。这一研究提示河北省流行的PAstV4是同物种重组毒株,为该病的流行病学调查提供科学依据,也为该病的防控提供理论基础。

主 题 词：猪星状病毒 全基因组 遗传进化分析 基因重组分析 

学科分类：090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

D　O　I：10.16303/j.cnki.1005-4545.2023.01.02

馆 藏 号：203118526...