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盔孢伞属真菌DNA条形码及微条形码技术

盔孢伞属真菌DNA条形码及微条形码技术

作     者:高崇华 刘晓亮 田恩静 GAO Chonghua;LIU Xiaoliang;TIAN Enjing

作者机构:吉林农业大学食药用菌教育部工程研究中心长春130118 

基  金:国家重点研发计划课题(2019YFC1604703) 国家自然科学基金应急项目(31750001) 

出 版 物:《菌物研究》 (Journal of Fungal Research)

年 卷 期:2022年第20卷第4期

页      码:298-310页

摘      要:收集盔孢伞属Galerina 16个物种40份标本,提取样品基因组DNA,使用通用引物扩增内转录间隔区(ITS)、基因内间隔区(IGS)、核糖体大亚基(nrLSU)、线粒体小亚基(mtSSU)、翻译延长因子(EF1-α)、RNA聚合酶第一大亚基(RPB1)、RNA聚合酶第二大亚基(RPB2)和β-微管蛋白(β-tubulin)8个基因序列进行双向测序,将得到的序列进行拼接校对后计算物种的种内、种间遗传距离并构建发育树。结果表明:ITS序列最适合作为盔孢伞属的DNA条形码,基于ITS序列开发出盔孢伞属的DNA微条形码、设计出微条形码引物。该引物具有良好的通用性和较强的适用性,对材料品质要求低,能够扩增由于蒸煮或消化等原因导致DNA发生降解的材料,具有一定的实际应用意义。

主 题 词:盔孢伞属 DNA条形码 DNA微条形码 物种鉴别 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 071001[071001] 07[理学] 

D O I:10.13341/j.jfr.2022.1514

馆 藏 号:203118692...

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