虚拟筛选和分子动力学模拟研究:筛选弗林蛋白酶的潜在抑制剂

作     者：孙丰垒 李晓毅 SUN Fenglei;LI Xiaoyi

作者机构：中国科学院大学材料科学与光电技术学院材料科学与光电技术中心北京100049 

基　　金：国家自然科学基金(21274164) 中央高校基本科研业务费专项资助 

出 版 物：《中国科学院大学学报（中英文）》 (Journal of University of Chinese Academy of Sciences)

年 卷 期：2023年第40卷第2期

页      码：173-178页

摘      要：通过分子对接和分子动力学模拟的方法,进行基于弗林蛋白(Furin)受体的虚拟筛选,以寻找Furin的潜在抑制剂。利用Sybyl软件构建基于Furin受体的药效团模型,在ZINC数据库中筛选出符合药效团模型的小分子,将小分子与Furin蛋白进行分子对接,最终筛选出4个符合条件的小分子。对4个复合物进行100 ns分子动力学模拟,并对轨迹进行RMSD和RMSF分析。通过分子力学-广义Born表面积法(MMGBSA)分析Furin受体和小分子配体平衡后的结合能,对比发现ZINC7664的结合能最低。所以小分子ZINC7664与Furin受体的结合最稳定,具有较好的应用前景,可用于设计有效的抑制Furin的药物。

主 题 词：弗林蛋白 虚拟筛选 分子对接 分子动力学模拟 

学科分类：081704[081704] 07[理学] 070304[070304] 08[工学] 0817[工学-轻工类] 0703[理学-化学类] 

核心收录：

D　O　I：10.7523/j.ucas.2021.0044

馆 藏 号：203118875...