青海省玉树藏族自治州鼠疫耶尔森菌CRISPR基因分型研究

作     者：靳娟 何建 李胜 杨晓艳 辛有全 张琪 杨建国 金泳 李广辉 张晓璐 代瑞霞 李伟 Jin Juan;He Jian;Li Sheng;Yang Xiaoyan;Xin Youquan;Zhang Qi;Yang Jianguo;Jin Yong;Li Guanghui;Zhang Xiaolu;Dai Ruixia;Li Wei

作者机构：青海省地方病预防控制所鼠疫菌专业实验室西宁810021 青海省地方病预防控制所鼠疫预防控制科西宁810021 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所鼠疫室北京102206 

基　　金：国家重点研发计划项目(2021YFC1200200) 国家自然科学基金(81660349) 国家卫生健康委鼠疫防治研究重点实验室(共建)项目(2019PT310004) 

出 版 物：《中华地方病学杂志》 (Chinese Journal of Endemiology)

年 卷 期：2023年第42卷第2期

页      码：111-115页

摘      要：目的了解青海省玉树藏族自治州(简称玉树州)鼠疫耶尔森菌(简称鼠疫菌)规律成簇的间隔短回文重复(CRISPR)的基因分型,探讨其遗传特征。方法选取1963-2007年分离自玉树州鼠疫自然疫源地的44株代表性鼠疫菌,提取DNA,针对CRISPR的3个位点(YPa、YPb和YPc)设计引物,进行PCR扩增,并对扩增产物进行测序及分析,鉴定CRISPR间区序列(spacer),确定CRISPR基因型和类群。结果44株鼠疫菌在CRISPR 3个位点上共有23种spacer,YPa位点14种、YPb位点6种、YPc位点3种,其中有2种新spacer,a106和a107。根据spacer阵列形式,44株鼠疫菌被分为15个CRISPR基因型、6个CRISPR类群,6个类群分别为Cb4、Cc3′、Ca7、Ca7′、Ca△5′和Ca35′,其中Ca7为主要流行类群(34株)。结论玉树州鼠疫菌CRISPR位点具有多种基因型,遗传多态性较高,种群结构复杂。

主 题 词：鼠疫(耶尔森氏)杆菌 规律成簇的间隔短回文重复 基因分型 

学科分类：1004[医学-公共卫生预防医学类] 100401[100401] 10[医学] 

D　O　I：10.3760/cma.j.cn231583-20220521-00180

馆 藏 号：203118980...