丹参2-C-甲基-D-赤藓糖醇2,4-环焦磷酸合成酶(SmMCS)基因全长克隆及其生物信息学分析

作     者：高伟 程琪庆 马晓惠 何云飞 蒋超 袁媛 黄璐琦 

作者机构：首都医科大学中医药学院北京100069 中国中医科学院中药研究所北京100700 成都中医药大学药学院四川成都611137 

基　　金：国家自然科学基金项目(30901965) 全国优秀博士学位论文作者专项资金项目(201188) 北京市自然科学基金项目(5102009) 北京市优秀人才培养资助个人项目(2011D005018000002) 

出 版 物：《中国中药杂志》 (China Journal of Chinese Materia Medica)

年 卷 期：2012年第37卷第22期

页      码：3365-3370页

摘      要：目的:从丹参毛状根中克隆2-C-甲基-D-赤藓糖醇2,4-环焦磷酸合成酶(SmMCS)全长基因,并进行生物信息学分析。方法:根据丹参转录组数据提供的基因片段设计特异引物,采用RACE方法克隆SmMCS全长cDNA,并对SmMCS进行蛋白结构预测、序列多重比对和构建进化树等分析;同时采用实时定量PCR检测Ag+诱导子诱导丹参毛状根不同时期的SmMCS基因转录水平。结果:克隆的SmMCS全长cDNA由988个核苷酸组成,具有完整编码框,编码234个氨基酸,蛋白相对分子质量约24.6 kDa,等电点pI 8.53;实时定量PCR结果表明该基因受Ag+诱导后表达水平在12 h时急剧上升并达到最高值。结论:从丹参毛状根中克隆得到一条SmMCS全长cDNA,为进一步研究丹参酮类成分的生物合成和萜类次生代谢提供靶基因。

主 题 词：丹参 2-C-甲基-D-赤藓糖醇2,4-环焦磷酸合成酶 cDNA末端快速扩增 生物信息学分析 

学科分类：1008[医学-中药学类] 1007[医学-药学类] 1006[医学-中西医结合类] 1005[医学-中医学类] 1004[医学-公共卫生预防医学类] 1002[医学-临床医学类] 1001[医学-基础医学] 100602[100602] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.4268/cjcmm20122205

馆 藏 号：203119190...