抑制剂PMI与MDM2结合模式的分子动力学研究

作     者：时术华 陈建中 张庆刚 张少龙 

作者机构：山东建筑大学理学院山东济南250101 山东交通学院理学院山东济南250023 山东师范大学物理与电子科学学院山东济南250014 

基　　金：国家自然科学基金项目(11274206) 山东省自然科学基金项目(ZR2011HM048) 山东建筑大学博士科研基金项目(XNBS1268) 

出 版 物：《山东建筑大学学报》 (Journal of Shandong Jianzhu University)

年 卷 期：2013年第28卷第2期

页      码：101-105页

摘      要：p53-MDM2相互作用已经成为治疗癌症药物设计的重要靶标。采用分子动力学模拟和MM-PBSA方法计算了肽类抑制剂PMI与MDM2的绝对结合自由能,通过基于残基的自由能分解方法计算了MDM2的各残基与PMI的相互作用。结果表明:CH-π、CH-CH和π-π相互作用驱动了PMI在MDM2疏水性裂缝中的结合;相关矩阵的计算表明PMI在一定程度上诱导了MDM2内部的相关运动。

主 题 词：物理化学 p53-MDM2相互作用 分子动力学模拟 相关矩阵 PMI 

学科分类：07[理学] 070203[070203] 0702[理学-物理学类] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1673-7644.2013.02.002

馆 藏 号：203119441...