应用T载体连接PCR技术分离黄嘴白鹭微卫星位点

作     者：黄勋和 周晓平 方文珍 陈小麟 HUANG Xun-he;ZHOU Xiao-ping;FANG Wen-zhen;CHEN Xiao-lin

作者机构：厦门大学生命科学学院滨海湿地生态系统教育部重点实验室福建厦门361005 

基　　金：国家自然科学基金项目(30970380 40876077 31000621) 福建省自然科学基金项目(2009J01195 2010Y2007) 河南省科技计划项目(102102110180) 

出 版 物：《厦门大学学报（自然科学版）》 (Journal of Xiamen University：Natural Science)

年 卷 期：2012年第51卷第2期

页      码：280-285页

摘      要：传统的微卫星分离策略对于低丰度的物种如鸟类而言,通常是低效的.探讨了一种改良的T载体PCR序列获取法用于黄嘴白鹭(Egretta eulophotes)微卫星DNA的分离,称为T载体连接PCR(T-vector-ligation PCR,TVL-PCR).在获取第一侧微卫星序列的71个阳性克隆中,59个克隆含有重复序列,设计了48对位点特异巢式引物.经过两轮TVL-PCR后,31个位点的扩增产物为预期大小,经测序后获得21个完整的微卫星位点.除去侧翼序列过短和小卫星位点外,设计16个微卫星位点进行多态信息检测,其中7个位点显示出多态性,平均等位基因数为2～20,观察杂合度(HO)和期望杂合度(HE)分别为0.375～0.958和0.477～0.956,所有位点都符合哈迪-温伯格平衡(HWE)和连锁平衡.说明TVL-PCR技术对低丰度微卫星物种的位点分离具有一定的应用价值.

主 题 词：微卫星分离 T载体连接PCR 黄嘴白鹭 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 0905[农学-林学类] 09[农学] 071007[071007] 090501[090501] 071002[071002] 

核心收录：

馆 藏 号：203119574...