基于红掌转录组序列的SSR标记分析与开发

作     者：郁永明 田丹青 潘晓韵 金亮 葛亚英 Yu Yongming;Tian Danqing;Pan Xiaoyun;Jin Liang;Ge Yaying

作者机构：浙江省农科院花卉研究开发中心杭州311202 

基　　金：浙江省自然科学基金(LQ14C150001) 浙江省花卉育种专项(2012C12909-17) 杭州市重大科技创新专项(20131812A18) 杭州市种子种苗项目(20120332H19)共同资助 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2015年第13卷第6期

页      码：1349-1354页

摘      要：本研究从红掌转录组共32 391条unigenes中搜索得到3 944个SSR位点,出现频率为12.17%。EST-SSR类型以一、二、三核苷酸重复为主,占总SSR比例的96.29%,其中二核苷重复为主要基序类型,占总SSR的51.01%,AG/CT重复类型出现最多。设计合成的200对SSR引物中有22对引物扩增条带清晰、多态性好,在18个红掌品种中得到有效性验证。结果表明,基于红掌转录组序列的SSR标记开发是可行的,这些EST-SSR的开发可为红掌遗传多样性分析、分子育种等奠定重要基础。

主 题 词：红掌 转录组 SSR 引物 

学科分类：090706[090706] 0907[农学-草药学] 09[农学] 

核心收录：

D　O　I：10.13271/j.mpb.013.001349

馆 藏 号：203120175...