斑茅NBS-LRR类抗病基因同源序列的克隆与分析

作     者：阙友雄 许莉萍 林剑伟 张木清 陈如凯 Que Youxiong;Xu Liping;Lin Jianwei;Zhang Muqing;Chen Rukai

作者机构：福建农林大学农业部甘蔗遗传改良重点开放实验室福州350002 

基　　金：国家高技术研究发展计划(863计划)项目(No.2007AA100701) 农业部引进国际先进农业科学技术计划(948计划)项目(No.2006-G37) 国家自然科学基金项目(No.30170639) 福建省科技厅国家科技项目备案(No.F2007AA100701)资助 

出 版 物：《热带作物学报》 (Chinese Journal of Tropical Crops)

年 卷 期：2009年第30卷第2期

页      码：192-197页

摘      要：根据已知NBS-LRR抗病基因[含有核苷酸结合位点(NBS)和富亮氨酸重复(LRR)的胞内受体蛋白基因]NBS结构域蛋白质的保守序列,设计简并引物,对斑茅基因组进行体外扩增,获得了对应区段的DNA片段,回收、克隆这些特异片段,测序分析,共获得8个片段序列。序列分析发现其中7个编号分别为RGA-Q1、RGA-Q2、RGA-Q3、RGA-Q4、RGA-Q5、RGA-Q6和RGA-Q7的片段推导的氨基酸序列均具有典型的NBS结构域,即P-loop(GGVGKTT)、Kinase-2a(VLDDVW)、Kinase-3a(GSR/KILVTTR)及疏水结构域HD(hydrophobic domain)。它们在NCBI上的登录号为EU685828、EU685829、EU685830、EU685831、EU685832、EU685833和EU685834。这些抗病基因同源片段(RGA)与已经克隆的N、L6、RPS2和Mi等11个抗病基因在氨基酸水平上的同源性为2.3%～39.8%,可进一步用作斑茅抗病候选基因的分子筛选及遗传图谱的构建。

主 题 词：班茅 保守区域 抗病基因同源序列 简并引物 

学科分类：09[农学] 0901[农学-植物生产类] 

核心收录：

D　O　I：10.3969/j.issn.1000-2561.2009.02.015

馆 藏 号：203120295...