基于SSR标记的42份樱花品种的聚类分析及DNA指纹图谱构建

作     者：孙泽硕 蒋冬月 柳新红 沈鑫 李因刚 屈雨飞 李永华 SUN Zeshuo;JIANG Dongyue;LIU Xinhong;SHEN Xin;LI Yingang;QU Yufei;LI Yonghua

作者机构：河南农业大学风景园林与艺术学院郑州450002 浙江省林业科学研究院杭州310023 浙江农林大学林业与生物技术学院杭州310023 

基　　金：国家自然科学基金青年基金项目(32101585) 浙江省公益技术研究计划项目(LGN21C160001) 

出 版 物：《园艺学报》 (Acta Horticulturae Sinica)

年 卷 期：2023年第50卷第3期

页      码：657-668页

摘      要：通过14对SSR引物基于UPGMA法对42份樱花品种进行聚类分析,并采用引物和基因型组合法构建DNA指纹图谱。结果表明:14对SSR引物共检测出187个等位基因,每对引物平均13.36个,有效等位基因平均6.10个,观察杂合度平均0.31,期望杂合度平均0.80,Shannon’s信息指数平均2.01,多态信息含量平均0.77;共检测出219个基因型,平均15.64个,平均区分率为22.11%。在Dice遗传相似系数约为0.18处时可分为3组,A组主要是山樱系、豆樱系和江户彼岸樱系的品种,B组是钟花樱系的品种,C组中只有尾叶樱;当Dice遗传相似系数约为0.37时,除八重红枝垂樱外,A组又可以分为6个小组。采用引物和基因型组合法构建了42份樱花品种的DNA指纹图谱,为今后樱花品种资源的分子鉴定提供依据。

主 题 词：樱花 SSR 品种 聚类分析 DNA指纹图谱 

学科分类：090706[090706] 0907[农学-草药学] 09[农学] 

核心收录：

D　O　I：10.16420/j.issn.0513-353x.2021-1057

馆 藏 号：203120979...