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盐城市1例奥密克戎阳性标本刺突蛋白生物信息学分析

盐城市1例奥密克戎阳性标本刺突蛋白生物信息学分析

作     者:王海燕 姚学君 陈国清 张海燕 安然 管书慧 李长城 张红军 WANG Hai-yan;YAO Xue-jun;CHEN Guo-qing;ZHANG Hai-yan;An Ran;GUAN Shu-hui;LI Chang-cheng;ZHANG Hong-jun

作者机构:盐城市疾病预防控制中心江苏盐城224000 

基  金:2020年度中国乙肝科研防控基金(YGFK20200083) 

出 版 物:《江苏预防医学》 (Jiangsu Journal of Preventive Medicine)

年 卷 期:2023年第34卷第1期

页      码:49-51,73页

摘      要:目的 应用生物信息学方法,分析新冠病毒奥密克戎阳性标本刺突蛋白(S)结构与功能,为抗病毒药物筛选和疫苗设计提供依据。方法 基于盐城市1例奥密克戎阳性标本S蛋白序列,采用生物信息学在线软件,预测分析S蛋白氨基酸组成、理化性质、糖基化修饰、二级结构和受体结合域等生物学特性。结果 该株奥密克戎阳性标本S蛋白为稳定的分泌性蛋白,存在跨膜螺旋区域、具有潜在的186个磷酸化位点、17个糖基化修饰位点和34个抗原细胞表位,蛋白质二级结构以无规则卷曲为主,发现4个有意义的保守结构域。结论 系统性分析奥密克戎毒株S蛋白结构与功能,有助于全面理解S蛋白生物信息学特征。

主 题 词:奥密克戎 刺突蛋白 生物信息学 

学科分类:1007[医学-药学类] 100705[100705] 1001[医学-基础医学] 100103[100103] 10[医学] 

D O I:10.13668/j.issn.1006-9070.2023.01.012

馆 藏 号:203121058...

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