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基于富集分析及分子对接探究胃复春干预慢性萎缩性胃炎机制及药效物质

基于富集分析及分子对接探究胃复春干预慢性萎缩性胃炎机制及药效物质

作     者:张道铭 陈琳慧 孙兴帅 ZHANG Daoming

作者机构:安徽庐江县人民医院安徽合肥231500 胡庆余堂药业有限公司中药研发中心浙江杭州311100 

基  金:上海市科委专项“上海医药战略大品种二次开发”(15DZ1900104) 

出 版 物:《中医临床研究》 (Clinical Journal Of Chinese Medicine)

年 卷 期:2023年第15卷第7期

页      码:7-14页

摘      要:目的:基于慢性萎缩性胃炎(Chronic Atrophic Gastritis,CAG)患者异常表达通路及生物过程,探究胃复春治疗CAG的作用机制及潜在的药效物质基础。方法:基于CAG患者表达芯片,采用基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)软件分析慢性萎缩性胃炎异常表达基因集并提取核心靶点作为潜在疾病靶点集。基于文献检索搜寻公开发表的胃复春入血成分,构建活性物质库,采用网络药理学的方法分析核心靶点及起效化合物,并通过药效团模型技术筛选潜在“核心靶点-起效成分”,采用药效团及分子对接技术进行验证。结果:功能基因组学分析结果显示,CAG患者病变通路主要与小分子代谢、细胞增殖、遗传突变相关,分别筛选去重,获得核心贡献基因135/279个。整合药理学及计算机辅助药物设计分析得出胃复春可能通过ent-Abierubesin D、橙皮素、异橙黄酮、Melissoidesin U、槲皮素等核心化合物作用于细胞周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)、信号转导因子和转录激活因子3(Signal Transducer and Activator of Transcription 3,STAT3)、半胱氨酸蛋白酶3(Caspase 3,CASP3)、MET原癌基因、糖原合成酶激酶3β(Glycogen Synthase Kinase 3 Beta,GSK3B)等靶点发挥治疗作用。结论:文章基于公开的胃复春的入血成分,通过异常通路及生物过程富集、活性化合物库构建、网络药理学分析、药效团模型筛选及验证,初步揭示了胃复春治疗CAG潜在的药效物质基础,为后续研究提供参考。

主 题 词:胃复春 基因富集 网络药理学 药效团模型 分子对接 

学科分类:1002[医学-临床医学类] 100201[100201] 10[医学] 

D O I:10.3969/j.issn.1674-7860.2023.07.002

馆 藏 号:203121389...

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