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锦葵科作物SSR标记在玫瑰茄中的通用性分析

锦葵科作物SSR标记在玫瑰茄中的通用性分析

作     者:李云清 谢瑞真 李静 林荔辉 陈冀涵 方平平 陶爱芬 LI Yunqing;XIE Ruizhen;LI Jing;LIN Lihui;CHEN Jihan;FANG Pingping;TAO Aifen

作者机构:福建农林大学作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室福建福州350002 福建省作物设计育种重点实验室福建福州350002 福建农林大学金山学院福建福州350002 

基  金:国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-16) 福建省南方麻类种质资源共享平台项目(PTJH20006) 福建农林大学校内创新基金项目(KFA17164A、KFA19028A) 

出 版 物:《福建农业学报》 (Fujian Journal of Agricultural Sciences)

年 卷 期:2023年第38卷第3期

页      码:302-311页

摘      要:【目的】丰富玫瑰茄(Hibiscus sabdariffa L.)SSR分子标记的种类和数量,验证锦葵科作物SSR标记在玫瑰茄中的通用性,进而分析玫瑰茄的遗传多样性。【方法】选取锦葵科红麻、棉花、黄秋葵和木槿等4种作物共62对SSR引物(木槿17对,其他各15对),对8份不同来源的玫瑰茄种质进行多态性分析。【结果】62对SSR引物中有58对具有通用性,占比为93.5%;通用性引物中有48对具有多态性,占比为82.8%;这些引物共扩增出246条条带,其中多态性条带239条,占比97.2%。同时,棉花有14对SSR引物具有多态性,多态性引物比率最高,达86.7%;其次是木槿,有82.4%的引物具有多态性,且其引物多态信息含量值(PIC)最高,为0.685;而黄秋葵和红麻多态性引物比率较低,分别为73.3%和66.7%。另外,聚类分析结果表明,在相似系数0.49处可将8份玫瑰茄种质分为3个各具特点的亚类,其中19FZ-76被单独聚为一类,表明这一种质与其他7份种质亲缘关系最远,遗传差异最大,聚类结果与其表型性状表现一致;而来自缅甸的19FZ-74和漳州本地种遗传相似系数最高,说明这两份种质的亲缘关系较近,遗传差异较小,表明我国福建种植的玫瑰茄品种与东南亚的品种有较近的血缘关系,有可能从东南亚引种而来。【结论】锦葵科作物的SSR引物在玫瑰茄中具有较好的通用性,筛选出的SSR标记可为玫瑰茄品种鉴定、亲缘关系分析、遗传图谱构建等遗传学研究提供可靠方法。

主 题 词:玫瑰茄 SSR标记 通用性 遗传多样性 

学科分类:09[农学] 0901[农学-植物生产类] 

D O I:10.19303/j.issn.1008-0384.2023.03.006

馆 藏 号:203121825...

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