宁夏野生岩羊PPRV全基因组测定与系统进化分析

作     者：阚龙飞 孟宪踊 闫飞虎 李元果 王铁成 徐钰 初冬 王卫东 李岳城 赵永坤 高玉伟 冯娜 夏咸柱 KAN Longfei;MENG Xianyong;YAN Feihu;LI Yuanguo;WANG Tiecheng;XU Yu;CHU Dong;WANG Weidong;LI Yuecheng;ZHAO Yongkun;GAO Yuwei;FENG Na;XIA Xianzhu

作者机构：吉林农业大学动物医学院长春130118 中国农业科学院长春兽医研究所吉林省人兽共患病预防与控制重点实验室长春130122 国家林业和草原局生物灾害防控中心沈阳110034 宁夏回族自治区森林病虫防治检疫总站银川750001 

基　　金：国家林业和草原局疫源疫病监测项目(2020076007) 

出 版 物：《野生动物学报》 (CHINESE JOURNAL OF WILDLIFE)

年 卷 期：2023年第44卷第3期

页      码：556-564页

摘      要：为探究宁夏野生岩羊(Pseudois nayaur)小反刍兽疫病毒(Peste des petits rumi-nants virus,PPRV)的分子遗传特征,根据Gen Bank公布的PPRV基因组序列设计并合成13对全基因组扩增引物,通过RT-PCR和DNA测序及拼接获取毒株(wild-bharal/China-NXYH/2021株)全基因组序列,借助DNASTAR和MEGA 7.0软件进行序列分析。结果显示:该毒株属于基因Ⅳ系,基因组全长为15954 nt;在系统进化上,与2013年以来中国流行株和2016—2017年蒙古流行株亲缘关系较近,共同组成一个小的进化分支;在全基因组一致性分析中,与国内新疆流行株goat/China-XJYL/2013一致性最高(99.4%),与国内其他野生动物PPRV株wild-bharal/China-Tibet/2008、Ibex/China-XJBZ/2015和Procapra-przewalskii/China-GS/2018的一致性分别为96.8%、98.8%和99.0%。在H和F蛋白氨基酸多态性分析中,发现该毒株H和F蛋白中均出现了独特的氨基酸突变,分别为H蛋白的R285Q、S421R和F蛋白的R/K/T3W、Q305R。结果表明,小反刍兽疫病毒已传入宁夏野生动物种群,为我国小反刍兽疫根除工作带来新的困难和挑战,需加强对宁夏野生动物PPRV感染情况的追踪和监测,以便及时从传染源和传播途径方面阻断PPRV的传播。

主 题 词：小反刍兽疫病毒 野生岩羊 宁夏 全基因组测定 系统进化分析 

学科分类：090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

D　O　I：10.12375/ysdwxb.20230310

馆 藏 号：203122711...