云平台下基因-基因相互作用识别算法

作     者：刘桂霞 李广力 李涵 LIU Guixia;LI Guangli;LI Han

作者机构：吉林大学计算机科学与技术学院长春130012 

基　　金：国家自然科学基金(批准号:61373051 61175023) 吉林省科技发展计划重点项目(批准号:20140204004GX) 吉林大学"大学生创新创业训练计划"项目(批准号:2013B53205) 

出 版 物：《吉林大学学报（理学版）》 (Journal of Jilin University:Science Edition)

年 卷 期：2014年第52卷第3期

页      码：546-550页

摘      要：针对现有的快速方差分析算法进行并行可扩展性改进,设计一种高效的并行计算模型,并提出一种基于MapReduce模型的基因-基因相互作用识别算法MR-ANOVA算法.该算法有效解决了现有基因-基因相互作用识别算法在海量数据规模下普遍存在计算复杂度过高的问题.实验结果表明,该算法充分利用了云平台的并行计算能力,随着数据量的增大,加速比逐渐接近于集群数量,可高效准确地完成基因-基因相互作用的识别.

主 题 词：基因-基因相互作用 MapReduce模型 云计算 

学科分类：08[工学] 0835[0835] 081202[081202] 0812[工学-测绘类] 

核心收录：

D　O　I：10.13413/j.cnki.jdxblxb.2014.03.26

馆 藏 号：203122733...